Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX6O95475 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX6O95475 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIX6O95475 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIX6O95475 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIX6O95475 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIX6O95475 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX6O95475 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX6O95475 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX6O95475 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX6O95475 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX6O95475 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX6O95475 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX6O95475 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX6O95475 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX6O95475 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX6O95475 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX6O95475 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX6O95475 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX6O95475 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX6O95475 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX6O95475 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX6O95475 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX6O95475 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX6O95475 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX6O95475 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX6O95475 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIX6O95475 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIX6O95475 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIX6O95475 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX6O95475 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX6O95475 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX6O95475 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX6O95475 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX6O95475 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX6O95475 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX6O95475 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX6O95475 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX6O95475 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX6O95475 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX6O95475 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX6O95475 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX6O95475 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX6O95475 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX6O95475 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX6O95475 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX6O95475 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX6O95475 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX6O95475 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX6O95475 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX6O95475 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX6O95475 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX6O95475 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX6O95475 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX6O95475 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIX6O95475 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIX6O95475 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIX6O95475 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX6O95475 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX6O95475 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX6O95475 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX6O95475 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX6O95475 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX6O95475 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX6O95475 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX6O95475 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX6O95475 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX6O95475 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX6O95475 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX6O95475 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX6O95475 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX6O95475 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX6O95475 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX6O95475 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIX6O95475 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX6O95475 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX6O95475 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX6O95475 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX6O95475 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX6O95475 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX6O95475 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX6O95475 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX6O95475 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX6O95475 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX6O95475 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX6O95475 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX6O95475 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX6O95475 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX6O95475 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIX6O95475 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX6O95475 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX6O95475 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX6O95475 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX6O95475 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX6O95475 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX6O95475 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX6O95475 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX6O95475 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX6O95475 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX6O95475 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms