Protein–RNA interactions for Protein: O75596

CLEC3A, C-type lectin domain family 3 member A, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3AO75596 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLEC3AO75596 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLEC3AO75596 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLEC3AO75596 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLEC3AO75596 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLEC3AO75596 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLEC3AO75596 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLEC3AO75596 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLEC3AO75596 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLEC3AO75596 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLEC3AO75596 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLEC3AO75596 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLEC3AO75596 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLEC3AO75596 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLEC3AO75596 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLEC3AO75596 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLEC3AO75596 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLEC3AO75596 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLEC3AO75596 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLEC3AO75596 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLEC3AO75596 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLEC3AO75596 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLEC3AO75596 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLEC3AO75596 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLEC3AO75596 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLEC3AO75596 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLEC3AO75596 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLEC3AO75596 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLEC3AO75596 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLEC3AO75596 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLEC3AO75596 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC3AO75596 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC3AO75596 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC3AO75596 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLEC3AO75596 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLEC3AO75596 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLEC3AO75596 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLEC3AO75596 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLEC3AO75596 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLEC3AO75596 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLEC3AO75596 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLEC3AO75596 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLEC3AO75596 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLEC3AO75596 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLEC3AO75596 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLEC3AO75596 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLEC3AO75596 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLEC3AO75596 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLEC3AO75596 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLEC3AO75596 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLEC3AO75596 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLEC3AO75596 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLEC3AO75596 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLEC3AO75596 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLEC3AO75596 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLEC3AO75596 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLEC3AO75596 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLEC3AO75596 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLEC3AO75596 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLEC3AO75596 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLEC3AO75596 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLEC3AO75596 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLEC3AO75596 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLEC3AO75596 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CLEC3AO75596 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLEC3AO75596 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLEC3AO75596 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLEC3AO75596 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLEC3AO75596 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLEC3AO75596 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLEC3AO75596 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLEC3AO75596 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLEC3AO75596 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLEC3AO75596 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLEC3AO75596 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLEC3AO75596 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLEC3AO75596 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms