Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNOT3O75175 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNOT3O75175 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CNOT3O75175 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNOT3O75175 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNOT3O75175 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNOT3O75175 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNOT3O75175 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNOT3O75175 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNOT3O75175 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNOT3O75175 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNOT3O75175 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNOT3O75175 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNOT3O75175 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNOT3O75175 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNOT3O75175 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNOT3O75175 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNOT3O75175 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNOT3O75175 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNOT3O75175 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNOT3O75175 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNOT3O75175 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNOT3O75175 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNOT3O75175 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNOT3O75175 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNOT3O75175 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNOT3O75175 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNOT3O75175 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNOT3O75175 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNOT3O75175 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT3O75175 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT3O75175 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT3O75175 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNOT3O75175 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNOT3O75175 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNOT3O75175 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CNOT3O75175 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT3O75175 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT3O75175 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT3O75175 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT3O75175 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT3O75175 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT3O75175 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT3O75175 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT3O75175 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT3O75175 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT3O75175 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT3O75175 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT3O75175 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT3O75175 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT3O75175 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT3O75175 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT3O75175 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT3O75175 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNOT3O75175 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT3O75175 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT3O75175 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT3O75175 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT3O75175 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT3O75175 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT3O75175 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT3O75175 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT3O75175 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT3O75175 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT3O75175 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT3O75175 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT3O75175 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT3O75175 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT3O75175 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT3O75175 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT3O75175 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT3O75175 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT3O75175 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT3O75175 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT3O75175 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT3O75175 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT3O75175 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT3O75175 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT3O75175 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT3O75175 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT3O75175 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT3O75175 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT3O75175 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT3O75175 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT3O75175 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNOT3O75175 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNOT3O75175 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNOT3O75175 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNOT3O75175 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT3O75175 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT3O75175 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNOT3O75175 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNOT3O75175 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNOT3O75175 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNOT3O75175 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT3O75175 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT3O75175 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT3O75175 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT3O75175 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT3O75175 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms