Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
EIF5BO60841 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
EIF5BO60841 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EIF5BO60841 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EIF5BO60841 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
EIF5BO60841 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
EIF5BO60841 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
EIF5BO60841 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
EIF5BO60841 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
EIF5BO60841 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
EIF5BO60841 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
EIF5BO60841 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
EIF5BO60841 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
EIF5BO60841 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EIF5BO60841 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EIF5BO60841 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
EIF5BO60841 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
EIF5BO60841 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
EIF5BO60841 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
EIF5BO60841 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
EIF5BO60841 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
EIF5BO60841 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
EIF5BO60841 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
EIF5BO60841 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
EIF5BO60841 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
EIF5BO60841 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EIF5BO60841 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
EIF5BO60841 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
EIF5BO60841 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
EIF5BO60841 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
EIF5BO60841 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EIF5BO60841 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EIF5BO60841 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
EIF5BO60841 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
EIF5BO60841 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
EIF5BO60841 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
EIF5BO60841 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
EIF5BO60841 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
EIF5BO60841 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
EIF5BO60841 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
EIF5BO60841 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
EIF5BO60841 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
EIF5BO60841 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
EIF5BO60841 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
EIF5BO60841 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EIF5BO60841 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EIF5BO60841 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EIF5BO60841 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
EIF5BO60841 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
EIF5BO60841 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
EIF5BO60841 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
EIF5BO60841 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
EIF5BO60841 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
EIF5BO60841 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
EIF5BO60841 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
EIF5BO60841 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
EIF5BO60841 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EIF5BO60841 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EIF5BO60841 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
EIF5BO60841 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
EIF5BO60841 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EIF5BO60841 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
EIF5BO60841 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EIF5BO60841 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
EIF5BO60841 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
EIF5BO60841 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
EIF5BO60841 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EIF5BO60841 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EIF5BO60841 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
EIF5BO60841 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EIF5BO60841 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
EIF5BO60841 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
EIF5BO60841 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EIF5BO60841 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EIF5BO60841 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
EIF5BO60841 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
EIF5BO60841 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.73
EIF5BO60841 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
EIF5BO60841 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EIF5BO60841 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
EIF5BO60841 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
EIF5BO60841 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
EIF5BO60841 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
EIF5BO60841 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EIF5BO60841 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EIF5BO60841 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
EIF5BO60841 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
EIF5BO60841 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
EIF5BO60841 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
EIF5BO60841 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
EIF5BO60841 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
EIF5BO60841 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
EIF5BO60841 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
EIF5BO60841 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
EIF5BO60841 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
EIF5BO60841 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
EIF5BO60841 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
EIF5BO60841 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
EIF5BO60841 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
EIF5BO60841 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms