Protein–RNA interactions for Protein: O60678

PRMT3, Protein arginine N-methyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT3O60678 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRMT3O60678 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRMT3O60678 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRMT3O60678 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRMT3O60678 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRMT3O60678 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRMT3O60678 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRMT3O60678 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRMT3O60678 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRMT3O60678 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRMT3O60678 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms