Protein–RNA interactions for Protein: O60678

PRMT3, Protein arginine N-methyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT3O60678 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRMT3O60678 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRMT3O60678 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRMT3O60678 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRMT3O60678 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRMT3O60678 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRMT3O60678 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRMT3O60678 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRMT3O60678 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRMT3O60678 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRMT3O60678 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRMT3O60678 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRMT3O60678 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRMT3O60678 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRMT3O60678 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRMT3O60678 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms