Protein–RNA interactions for Protein: O60678

PRMT3, Protein arginine N-methyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT3O60678 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRMT3O60678 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRMT3O60678 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRMT3O60678 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PRMT3O60678 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRMT3O60678 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PRMT3O60678 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PRMT3O60678 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRMT3O60678 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRMT3O60678 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRMT3O60678 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRMT3O60678 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRMT3O60678 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRMT3O60678 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRMT3O60678 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRMT3O60678 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRMT3O60678 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRMT3O60678 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRMT3O60678 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRMT3O60678 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRMT3O60678 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRMT3O60678 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRMT3O60678 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRMT3O60678 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRMT3O60678 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRMT3O60678 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRMT3O60678 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRMT3O60678 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRMT3O60678 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PRMT3O60678 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRMT3O60678 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRMT3O60678 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRMT3O60678 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRMT3O60678 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRMT3O60678 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRMT3O60678 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRMT3O60678 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRMT3O60678 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRMT3O60678 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRMT3O60678 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRMT3O60678 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRMT3O60678 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRMT3O60678 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRMT3O60678 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRMT3O60678 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRMT3O60678 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRMT3O60678 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRMT3O60678 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRMT3O60678 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRMT3O60678 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRMT3O60678 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRMT3O60678 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRMT3O60678 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRMT3O60678 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRMT3O60678 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRMT3O60678 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRMT3O60678 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRMT3O60678 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRMT3O60678 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRMT3O60678 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRMT3O60678 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRMT3O60678 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRMT3O60678 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRMT3O60678 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRMT3O60678 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRMT3O60678 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRMT3O60678 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRMT3O60678 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRMT3O60678 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRMT3O60678 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRMT3O60678 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRMT3O60678 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRMT3O60678 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRMT3O60678 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRMT3O60678 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRMT3O60678 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRMT3O60678 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRMT3O60678 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRMT3O60678 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRMT3O60678 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRMT3O60678 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRMT3O60678 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRMT3O60678 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRMT3O60678 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRMT3O60678 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRMT3O60678 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRMT3O60678 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRMT3O60678 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PRMT3O60678 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRMT3O60678 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRMT3O60678 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRMT3O60678 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRMT3O60678 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRMT3O60678 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRMT3O60678 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRMT3O60678 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRMT3O60678 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRMT3O60678 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRMT3O60678 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRMT3O60678 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms