Protein–RNA interactions for Protein: O15535

ZSCAN9, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN9O15535 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZSCAN9O15535 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZSCAN9O15535 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZSCAN9O15535 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ZSCAN9O15535 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZSCAN9O15535 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZSCAN9O15535 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZSCAN9O15535 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZSCAN9O15535 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZSCAN9O15535 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZSCAN9O15535 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZSCAN9O15535 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZSCAN9O15535 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZSCAN9O15535 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZSCAN9O15535 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZSCAN9O15535 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZSCAN9O15535 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZSCAN9O15535 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZSCAN9O15535 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZSCAN9O15535 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZSCAN9O15535 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZSCAN9O15535 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZSCAN9O15535 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZSCAN9O15535 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZSCAN9O15535 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZSCAN9O15535 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZSCAN9O15535 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZSCAN9O15535 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZSCAN9O15535 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZSCAN9O15535 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZSCAN9O15535 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZSCAN9O15535 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZSCAN9O15535 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZSCAN9O15535 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZSCAN9O15535 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZSCAN9O15535 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZSCAN9O15535 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZSCAN9O15535 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZSCAN9O15535 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZSCAN9O15535 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSCAN9O15535 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSCAN9O15535 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSCAN9O15535 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSCAN9O15535 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSCAN9O15535 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSCAN9O15535 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSCAN9O15535 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSCAN9O15535 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSCAN9O15535 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZSCAN9O15535 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZSCAN9O15535 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZSCAN9O15535 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZSCAN9O15535 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZSCAN9O15535 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZSCAN9O15535 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZSCAN9O15535 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZSCAN9O15535 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZSCAN9O15535 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZSCAN9O15535 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZSCAN9O15535 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZSCAN9O15535 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZSCAN9O15535 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZSCAN9O15535 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZSCAN9O15535 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZSCAN9O15535 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZSCAN9O15535 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZSCAN9O15535 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZSCAN9O15535 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZSCAN9O15535 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZSCAN9O15535 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZSCAN9O15535 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZSCAN9O15535 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZSCAN9O15535 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZSCAN9O15535 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZSCAN9O15535 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZSCAN9O15535 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZSCAN9O15535 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZSCAN9O15535 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZSCAN9O15535 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZSCAN9O15535 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZSCAN9O15535 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZSCAN9O15535 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZSCAN9O15535 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZSCAN9O15535 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZSCAN9O15535 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSCAN9O15535 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSCAN9O15535 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZSCAN9O15535 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZSCAN9O15535 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZSCAN9O15535 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSCAN9O15535 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSCAN9O15535 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSCAN9O15535 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSCAN9O15535 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSCAN9O15535 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSCAN9O15535 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSCAN9O15535 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSCAN9O15535 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSCAN9O15535 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSCAN9O15535 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms