Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIN7AO14910 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIN7AO14910 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIN7AO14910 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LIN7AO14910 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LIN7AO14910 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LIN7AO14910 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LIN7AO14910 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LIN7AO14910 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LIN7AO14910 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LIN7AO14910 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LIN7AO14910 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIN7AO14910 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIN7AO14910 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIN7AO14910 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIN7AO14910 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LIN7AO14910 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LIN7AO14910 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LIN7AO14910 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIN7AO14910 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LIN7AO14910 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LIN7AO14910 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LIN7AO14910 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LIN7AO14910 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIN7AO14910 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIN7AO14910 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIN7AO14910 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIN7AO14910 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LIN7AO14910 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LIN7AO14910 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LIN7AO14910 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LIN7AO14910 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LIN7AO14910 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIN7AO14910 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIN7AO14910 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIN7AO14910 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIN7AO14910 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIN7AO14910 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LIN7AO14910 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LIN7AO14910 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LIN7AO14910 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LIN7AO14910 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LIN7AO14910 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LIN7AO14910 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LIN7AO14910 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LIN7AO14910 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LIN7AO14910 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LIN7AO14910 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LIN7AO14910 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LIN7AO14910 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LIN7AO14910 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LIN7AO14910 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LIN7AO14910 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LIN7AO14910 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LIN7AO14910 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms