Protein–RNA interactions for Protein: O14594

NCAN, Neurocan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCANO14594 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCANO14594 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCANO14594 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCANO14594 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCANO14594 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCANO14594 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCANO14594 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCANO14594 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCANO14594 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCANO14594 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCANO14594 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCANO14594 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCANO14594 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCANO14594 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCANO14594 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCANO14594 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCANO14594 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCANO14594 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCANO14594 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NCANO14594 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCANO14594 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCANO14594 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCANO14594 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCANO14594 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCANO14594 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCANO14594 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCANO14594 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCANO14594 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCANO14594 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCANO14594 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCANO14594 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCANO14594 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCANO14594 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCANO14594 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NCANO14594 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCANO14594 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NCANO14594 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCANO14594 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCANO14594 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NCANO14594 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCANO14594 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NCANO14594 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCANO14594 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCANO14594 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCANO14594 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NCANO14594 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCANO14594 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCANO14594 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCANO14594 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCANO14594 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCANO14594 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NCANO14594 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCANO14594 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCANO14594 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCANO14594 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCANO14594 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCANO14594 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCANO14594 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCANO14594 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCANO14594 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCANO14594 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCANO14594 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCANO14594 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCANO14594 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCANO14594 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCANO14594 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCANO14594 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCANO14594 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCANO14594 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCANO14594 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCANO14594 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCANO14594 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NCANO14594 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCANO14594 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCANO14594 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCANO14594 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCANO14594 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCANO14594 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NCANO14594 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCANO14594 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCANO14594 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCANO14594 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCANO14594 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NCANO14594 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCANO14594 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCANO14594 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCANO14594 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCANO14594 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCANO14594 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCANO14594 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCANO14594 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCANO14594 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
NCANO14594 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCANO14594 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCANO14594 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCANO14594 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCANO14594 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCANO14594 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCANO14594 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCANO14594 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms