Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LAD1O00515 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LAD1O00515 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LAD1O00515 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LAD1O00515 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LAD1O00515 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LAD1O00515 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAD1O00515 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LAD1O00515 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LAD1O00515 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LAD1O00515 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LAD1O00515 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LAD1O00515 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LAD1O00515 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LAD1O00515 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LAD1O00515 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LAD1O00515 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LAD1O00515 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LAD1O00515 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LAD1O00515 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LAD1O00515 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
LAD1O00515 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LAD1O00515 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LAD1O00515 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAD1O00515 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAD1O00515 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAD1O00515 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAD1O00515 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAD1O00515 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
LAD1O00515 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAD1O00515 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAD1O00515 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
LAD1O00515 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LAD1O00515 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LAD1O00515 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LAD1O00515 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
LAD1O00515 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LAD1O00515 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LAD1O00515 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LAD1O00515 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LAD1O00515 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LAD1O00515 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LAD1O00515 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LAD1O00515 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LAD1O00515 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LAD1O00515 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LAD1O00515 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LAD1O00515 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LAD1O00515 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
LAD1O00515 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LAD1O00515 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LAD1O00515 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LAD1O00515 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAD1O00515 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAD1O00515 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LAD1O00515 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LAD1O00515 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LAD1O00515 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAD1O00515 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAD1O00515 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
LAD1O00515 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LAD1O00515 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LAD1O00515 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LAD1O00515 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LAD1O00515 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAD1O00515 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAD1O00515 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAD1O00515 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAD1O00515 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAD1O00515 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAD1O00515 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
LAD1O00515 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LAD1O00515 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LAD1O00515 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LAD1O00515 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LAD1O00515 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LAD1O00515 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAD1O00515 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAD1O00515 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAD1O00515 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAD1O00515 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAD1O00515 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAD1O00515 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAD1O00515 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAD1O00515 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAD1O00515 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAD1O00515 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LAD1O00515 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LAD1O00515 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LAD1O00515 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LAD1O00515 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LAD1O00515 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAD1O00515 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAD1O00515 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LAD1O00515 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LAD1O00515 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAD1O00515 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
LAD1O00515 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAD1O00515 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LAD1O00515 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms