Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HIP1O00291 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
HIP1O00291 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
HIP1O00291 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HIP1O00291 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HIP1O00291 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HIP1O00291 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HIP1O00291 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HIP1O00291 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HIP1O00291 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HIP1O00291 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HIP1O00291 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
HIP1O00291 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HIP1O00291 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HIP1O00291 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HIP1O00291 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HIP1O00291 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HIP1O00291 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HIP1O00291 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HIP1O00291 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HIP1O00291 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HIP1O00291 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HIP1O00291 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HIP1O00291 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
HIP1O00291 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HIP1O00291 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HIP1O00291 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HIP1O00291 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
HIP1O00291 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HIP1O00291 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HIP1O00291 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HIP1O00291 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HIP1O00291 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
HIP1O00291 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HIP1O00291 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
HIP1O00291 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HIP1O00291 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
HIP1O00291 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HIP1O00291 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HIP1O00291 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HIP1O00291 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HIP1O00291 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HIP1O00291 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HIP1O00291 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HIP1O00291 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HIP1O00291 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HIP1O00291 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HIP1O00291 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HIP1O00291 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HIP1O00291 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HIP1O00291 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HIP1O00291 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HIP1O00291 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HIP1O00291 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HIP1O00291 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HIP1O00291 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
HIP1O00291 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HIP1O00291 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HIP1O00291 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
HIP1O00291 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
HIP1O00291 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
HIP1O00291 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
HIP1O00291 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HIP1O00291 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
HIP1O00291 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
HIP1O00291 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HIP1O00291 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HIP1O00291 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HIP1O00291 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HIP1O00291 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HIP1O00291 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HIP1O00291 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
HIP1O00291 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HIP1O00291 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
HIP1O00291 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
HIP1O00291 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
HIP1O00291 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HIP1O00291 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
HIP1O00291 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HIP1O00291 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HIP1O00291 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HIP1O00291 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HIP1O00291 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HIP1O00291 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HIP1O00291 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HIP1O00291 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HIP1O00291 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
HIP1O00291 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
HIP1O00291 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
HIP1O00291 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
HIP1O00291 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
HIP1O00291 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
HIP1O00291 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
HIP1O00291 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
HIP1O00291 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
HIP1O00291 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HIP1O00291 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HIP1O00291 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HIP1O00291 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
HIP1O00291 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms