Protein–RNA interactions for Protein: O00214

LGALS8, Galectin-8, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS8O00214 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGALS8O00214 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGALS8O00214 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGALS8O00214 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGALS8O00214 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGALS8O00214 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LGALS8O00214 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LGALS8O00214 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGALS8O00214 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGALS8O00214 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGALS8O00214 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGALS8O00214 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGALS8O00214 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGALS8O00214 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGALS8O00214 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGALS8O00214 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGALS8O00214 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LGALS8O00214 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LGALS8O00214 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LGALS8O00214 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGALS8O00214 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGALS8O00214 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGALS8O00214 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGALS8O00214 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGALS8O00214 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LGALS8O00214 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGALS8O00214 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGALS8O00214 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGALS8O00214 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGALS8O00214 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGALS8O00214 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGALS8O00214 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGALS8O00214 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGALS8O00214 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGALS8O00214 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGALS8O00214 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGALS8O00214 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGALS8O00214 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGALS8O00214 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGALS8O00214 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGALS8O00214 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LGALS8O00214 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGALS8O00214 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LGALS8O00214 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGALS8O00214 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGALS8O00214 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGALS8O00214 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGALS8O00214 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGALS8O00214 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGALS8O00214 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGALS8O00214 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGALS8O00214 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGALS8O00214 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGALS8O00214 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGALS8O00214 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGALS8O00214 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGALS8O00214 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGALS8O00214 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGALS8O00214 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGALS8O00214 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGALS8O00214 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGALS8O00214 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGALS8O00214 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGALS8O00214 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGALS8O00214 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGALS8O00214 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGALS8O00214 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGALS8O00214 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGALS8O00214 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGALS8O00214 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGALS8O00214 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGALS8O00214 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGALS8O00214 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGALS8O00214 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LGALS8O00214 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGALS8O00214 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGALS8O00214 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGALS8O00214 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGALS8O00214 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGALS8O00214 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGALS8O00214 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGALS8O00214 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGALS8O00214 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGALS8O00214 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGALS8O00214 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGALS8O00214 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGALS8O00214 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGALS8O00214 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGALS8O00214 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGALS8O00214 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGALS8O00214 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGALS8O00214 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGALS8O00214 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LGALS8O00214 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGALS8O00214 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGALS8O00214 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGALS8O00214 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGALS8O00214 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGALS8O00214 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGALS8O00214 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms