Protein–RNA interactions for Protein: M0QZD8

LOC400499, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOC400499M0QZD8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LOC400499M0QZD8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LOC400499M0QZD8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LOC400499M0QZD8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LOC400499M0QZD8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LOC400499M0QZD8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LOC400499M0QZD8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LOC400499M0QZD8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LOC400499M0QZD8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LOC400499M0QZD8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LOC400499M0QZD8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LOC400499M0QZD8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LOC400499M0QZD8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LOC400499M0QZD8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LOC400499M0QZD8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LOC400499M0QZD8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LOC400499M0QZD8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LOC400499M0QZD8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LOC400499M0QZD8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LOC400499M0QZD8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LOC400499M0QZD8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LOC400499M0QZD8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LOC400499M0QZD8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LOC400499M0QZD8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LOC400499M0QZD8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LOC400499M0QZD8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LOC400499M0QZD8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LOC400499M0QZD8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LOC400499M0QZD8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LOC400499M0QZD8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LOC400499M0QZD8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LOC400499M0QZD8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LOC400499M0QZD8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LOC400499M0QZD8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LOC400499M0QZD8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LOC400499M0QZD8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LOC400499M0QZD8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LOC400499M0QZD8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LOC400499M0QZD8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LOC400499M0QZD8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LOC400499M0QZD8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LOC400499M0QZD8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LOC400499M0QZD8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LOC400499M0QZD8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LOC400499M0QZD8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LOC400499M0QZD8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LOC400499M0QZD8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LOC400499M0QZD8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LOC400499M0QZD8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LOC400499M0QZD8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LOC400499M0QZD8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LOC400499M0QZD8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LOC400499M0QZD8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LOC400499M0QZD8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LOC400499M0QZD8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LOC400499M0QZD8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LOC400499M0QZD8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LOC400499M0QZD8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LOC400499M0QZD8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LOC400499M0QZD8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LOC400499M0QZD8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LOC400499M0QZD8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LOC400499M0QZD8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LOC400499M0QZD8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LOC400499M0QZD8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LOC400499M0QZD8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LOC400499M0QZD8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LOC400499M0QZD8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LOC400499M0QZD8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LOC400499M0QZD8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LOC400499M0QZD8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LOC400499M0QZD8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LOC400499M0QZD8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LOC400499M0QZD8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LOC400499M0QZD8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LOC400499M0QZD8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LOC400499M0QZD8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LOC400499M0QZD8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LOC400499M0QZD8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LOC400499M0QZD8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LOC400499M0QZD8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LOC400499M0QZD8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LOC400499M0QZD8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LOC400499M0QZD8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LOC400499M0QZD8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LOC400499M0QZD8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LOC400499M0QZD8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LOC400499M0QZD8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LOC400499M0QZD8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LOC400499M0QZD8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LOC400499M0QZD8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LOC400499M0QZD8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LOC400499M0QZD8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LOC400499M0QZD8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LOC400499M0QZD8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LOC400499M0QZD8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LOC400499M0QZD8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LOC400499M0QZD8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LOC400499M0QZD8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LOC400499M0QZD8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms