Protein–RNA interactions for Protein: C9JLR9

C11orf95, Uncharacterized protein C11orf95, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf95C9JLR9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
C11orf95C9JLR9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
C11orf95C9JLR9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
C11orf95C9JLR9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
C11orf95C9JLR9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
C11orf95C9JLR9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
C11orf95C9JLR9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
C11orf95C9JLR9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
C11orf95C9JLR9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
C11orf95C9JLR9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
C11orf95C9JLR9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
C11orf95C9JLR9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
C11orf95C9JLR9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
C11orf95C9JLR9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
C11orf95C9JLR9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
C11orf95C9JLR9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
C11orf95C9JLR9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
C11orf95C9JLR9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
C11orf95C9JLR9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
C11orf95C9JLR9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
C11orf95C9JLR9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
C11orf95C9JLR9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
C11orf95C9JLR9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
C11orf95C9JLR9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
C11orf95C9JLR9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
C11orf95C9JLR9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
C11orf95C9JLR9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
C11orf95C9JLR9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
C11orf95C9JLR9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
C11orf95C9JLR9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
C11orf95C9JLR9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
C11orf95C9JLR9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
C11orf95C9JLR9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
C11orf95C9JLR9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
C11orf95C9JLR9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
C11orf95C9JLR9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
C11orf95C9JLR9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
C11orf95C9JLR9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
C11orf95C9JLR9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
C11orf95C9JLR9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
C11orf95C9JLR9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
C11orf95C9JLR9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
C11orf95C9JLR9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
C11orf95C9JLR9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
C11orf95C9JLR9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
C11orf95C9JLR9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
C11orf95C9JLR9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
C11orf95C9JLR9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
C11orf95C9JLR9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
C11orf95C9JLR9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
C11orf95C9JLR9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
C11orf95C9JLR9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
C11orf95C9JLR9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
C11orf95C9JLR9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
C11orf95C9JLR9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
C11orf95C9JLR9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
C11orf95C9JLR9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
C11orf95C9JLR9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
C11orf95C9JLR9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
C11orf95C9JLR9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
C11orf95C9JLR9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
C11orf95C9JLR9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
C11orf95C9JLR9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
C11orf95C9JLR9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
C11orf95C9JLR9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
C11orf95C9JLR9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
C11orf95C9JLR9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
C11orf95C9JLR9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.54
C11orf95C9JLR9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
C11orf95C9JLR9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
C11orf95C9JLR9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
C11orf95C9JLR9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
C11orf95C9JLR9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
C11orf95C9JLR9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
C11orf95C9JLR9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
C11orf95C9JLR9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
C11orf95C9JLR9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
C11orf95C9JLR9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
C11orf95C9JLR9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
C11orf95C9JLR9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
C11orf95C9JLR9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
C11orf95C9JLR9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
C11orf95C9JLR9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
C11orf95C9JLR9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
C11orf95C9JLR9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
C11orf95C9JLR9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
C11orf95C9JLR9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
C11orf95C9JLR9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
C11orf95C9JLR9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
C11orf95C9JLR9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
C11orf95C9JLR9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
C11orf95C9JLR9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
C11orf95C9JLR9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
C11orf95C9JLR9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
C11orf95C9JLR9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
C11orf95C9JLR9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
C11orf95C9JLR9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
C11orf95C9JLR9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
C11orf95C9JLR9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
C11orf95C9JLR9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms