Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
A8MVJ9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A8MVJ9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A8MVJ9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A8MVJ9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A8MVJ9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A8MVJ9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A8MVJ9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A8MVJ9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A8MVJ9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A8MVJ9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A8MVJ9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A8MVJ9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
A8MVJ9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A8MVJ9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A8MVJ9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A8MVJ9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A8MVJ9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A8MVJ9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A8MVJ9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A8MVJ9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A8MVJ9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A8MVJ9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A8MVJ9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A8MVJ9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A8MVJ9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A8MVJ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A8MVJ9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A8MVJ9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
A8MVJ9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A8MVJ9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
A8MVJ9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A8MVJ9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A8MVJ9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A8MVJ9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A8MVJ9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A8MVJ9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
A8MVJ9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
A8MVJ9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A8MVJ9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A8MVJ9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A8MVJ9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A8MVJ9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A8MVJ9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A8MVJ9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A8MVJ9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A8MVJ9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
A8MVJ9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A8MVJ9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A8MVJ9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A8MVJ9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A8MVJ9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A8MVJ9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A8MVJ9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A8MVJ9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
A8MVJ9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
A8MVJ9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A8MVJ9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A8MVJ9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A8MVJ9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A8MVJ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A8MVJ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A8MVJ9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A8MVJ9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A8MVJ9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A8MVJ9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A8MVJ9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A8MVJ9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
A8MVJ9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A8MVJ9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A8MVJ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A8MVJ9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A8MVJ9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A8MVJ9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A8MVJ9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A8MVJ9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A8MVJ9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A8MVJ9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A8MVJ9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A8MVJ9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A8MVJ9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A8MVJ9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A8MVJ9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A8MVJ9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
A8MVJ9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A8MVJ9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A8MVJ9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A8MVJ9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A8MVJ9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A8MVJ9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A8MVJ9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A8MVJ9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A8MVJ9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A8MVJ9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A8MVJ9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A8MVJ9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A8MVJ9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A8MVJ9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A8MVJ9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A8MVJ9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms