Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM149AA5PLN7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM149AA5PLN7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM149AA5PLN7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM149AA5PLN7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM149AA5PLN7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM149AA5PLN7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM149AA5PLN7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FAM149AA5PLN7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM149AA5PLN7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM149AA5PLN7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM149AA5PLN7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM149AA5PLN7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM149AA5PLN7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM149AA5PLN7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM149AA5PLN7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM149AA5PLN7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM149AA5PLN7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM149AA5PLN7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM149AA5PLN7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM149AA5PLN7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM149AA5PLN7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM149AA5PLN7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM149AA5PLN7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FAM149AA5PLN7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FAM149AA5PLN7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM149AA5PLN7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM149AA5PLN7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM149AA5PLN7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM149AA5PLN7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM149AA5PLN7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM149AA5PLN7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM149AA5PLN7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM149AA5PLN7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM149AA5PLN7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM149AA5PLN7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM149AA5PLN7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM149AA5PLN7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM149AA5PLN7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM149AA5PLN7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM149AA5PLN7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM149AA5PLN7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM149AA5PLN7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM149AA5PLN7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM149AA5PLN7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM149AA5PLN7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM149AA5PLN7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM149AA5PLN7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM149AA5PLN7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM149AA5PLN7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM149AA5PLN7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM149AA5PLN7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM149AA5PLN7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM149AA5PLN7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM149AA5PLN7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM149AA5PLN7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM149AA5PLN7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM149AA5PLN7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM149AA5PLN7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM149AA5PLN7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM149AA5PLN7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM149AA5PLN7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM149AA5PLN7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM149AA5PLN7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM149AA5PLN7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM149AA5PLN7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM149AA5PLN7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM149AA5PLN7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM149AA5PLN7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM149AA5PLN7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM149AA5PLN7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM149AA5PLN7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM149AA5PLN7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM149AA5PLN7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM149AA5PLN7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM149AA5PLN7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM149AA5PLN7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM149AA5PLN7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM149AA5PLN7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM149AA5PLN7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM149AA5PLN7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM149AA5PLN7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM149AA5PLN7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM149AA5PLN7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM149AA5PLN7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM149AA5PLN7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM149AA5PLN7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM149AA5PLN7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM149AA5PLN7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM149AA5PLN7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM149AA5PLN7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM149AA5PLN7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM149AA5PLN7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM149AA5PLN7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM149AA5PLN7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM149AA5PLN7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM149AA5PLN7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM149AA5PLN7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM149AA5PLN7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM149AA5PLN7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms