Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY99

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY99 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A0A0J9YY99 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A0A0J9YY99 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A0A0J9YY99 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A0A0J9YY99 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A0A0J9YY99 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A0A0J9YY99 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A0A0J9YY99 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A0A0J9YY99 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A0A0J9YY99 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A0A0J9YY99 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
A0A0J9YY99 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A0A0J9YY99 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A0A0J9YY99 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
A0A0J9YY99 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A0J9YY99 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A0J9YY99 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A0J9YY99 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A0J9YY99 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A0J9YY99 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A0J9YY99 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A0J9YY99 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0J9YY99 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0J9YY99 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0J9YY99 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0J9YY99 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0J9YY99 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0J9YY99 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0J9YY99 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0J9YY99 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0J9YY99 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0J9YY99 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0J9YY99 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0J9YY99 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0J9YY99 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0J9YY99 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A0A0J9YY99 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A0A0J9YY99 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A0A0J9YY99 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A0A0J9YY99 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A0A0J9YY99 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A0A0J9YY99 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A0A0J9YY99 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
A0A0J9YY99 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
A0A0J9YY99 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
A0A0J9YY99 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0J9YY99 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0J9YY99 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0J9YY99 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0J9YY99 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0J9YY99 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0J9YY99 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0J9YY99 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0J9YY99 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A0A0J9YY99 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A0A0J9YY99 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
A0A0J9YY99 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
A0A0J9YY99 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
A0A0J9YY99 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A0A0J9YY99 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
A0A0J9YY99 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
A0A0J9YY99 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
A0A0J9YY99 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
A0A0J9YY99 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
A0A0J9YY99 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
A0A0J9YY99 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
A0A0J9YY99 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
A0A0J9YY99 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
A0A0J9YY99 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
A0A0J9YY99 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
A0A0J9YY99 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
A0A0J9YY99 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
A0A0J9YY99 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
A0A0J9YY99 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A0A0J9YY99 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1636.3 ms