Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRAT1Q92837 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms