Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

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Length 62 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCP4P48539 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCP4P48539 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCP4P48539 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCP4P48539 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCP4P48539 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCP4P48539 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCP4P48539 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCP4P48539 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCP4P48539 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCP4P48539 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCP4P48539 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCP4P48539 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCP4P48539 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCP4P48539 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCP4P48539 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCP4P48539 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCP4P48539 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCP4P48539 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCP4P48539 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCP4P48539 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCP4P48539 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCP4P48539 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCP4P48539 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCP4P48539 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCP4P48539 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCP4P48539 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCP4P48539 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCP4P48539 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCP4P48539 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCP4P48539 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCP4P48539 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCP4P48539 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCP4P48539 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCP4P48539 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCP4P48539 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCP4P48539 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCP4P48539 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCP4P48539 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCP4P48539 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCP4P48539 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCP4P48539 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCP4P48539 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCP4P48539 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCP4P48539 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCP4P48539 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCP4P48539 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCP4P48539 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCP4P48539 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCP4P48539 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCP4P48539 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCP4P48539 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCP4P48539 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCP4P48539 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCP4P48539 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCP4P48539 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCP4P48539 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCP4P48539 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCP4P48539 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCP4P48539 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCP4P48539 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCP4P48539 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCP4P48539 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCP4P48539 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCP4P48539 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCP4P48539 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCP4P48539 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCP4P48539 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCP4P48539 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCP4P48539 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCP4P48539 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCP4P48539 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCP4P48539 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCP4P48539 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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