Protein–RNA interactions for Protein: O15444

CCL25, C-C motif chemokine 25, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL25O15444 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL25O15444 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL25O15444 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL25O15444 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL25O15444 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL25O15444 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL25O15444 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL25O15444 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL25O15444 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL25O15444 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL25O15444 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL25O15444 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL25O15444 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL25O15444 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL25O15444 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL25O15444 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL25O15444 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL25O15444 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL25O15444 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL25O15444 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL25O15444 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL25O15444 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL25O15444 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL25O15444 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL25O15444 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL25O15444 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL25O15444 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL25O15444 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL25O15444 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL25O15444 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL25O15444 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL25O15444 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL25O15444 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL25O15444 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL25O15444 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL25O15444 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL25O15444 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL25O15444 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL25O15444 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL25O15444 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL25O15444 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL25O15444 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL25O15444 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL25O15444 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL25O15444 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CCL25O15444 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL25O15444 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL25O15444 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL25O15444 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL25O15444 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL25O15444 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL25O15444 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CCL25O15444 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL25O15444 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL25O15444 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CCL25O15444 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CCL25O15444 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL25O15444 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL25O15444 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL25O15444 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL25O15444 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL25O15444 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL25O15444 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CCL25O15444 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL25O15444 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL25O15444 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL25O15444 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL25O15444 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL25O15444 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL25O15444 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL25O15444 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL25O15444 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL25O15444 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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CCL25O15444 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL25O15444 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL25O15444 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL25O15444 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL25O15444 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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