Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.314e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 TXNDC5-203ENST00000469459 715 ntTSL 212.58□□□□□ -0.44e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 ANKZF1-219ENST00000483188 529 ntTSL 212.25□□□□□ -0.454e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 PGM2-202ENST00000505986 1646 ntTSL 212.21□□□□□ -0.464e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 ODF2-216ENST00000483070 723 ntTSL 511.93□□□□□ -0.54e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 ATF7-202ENST00000456903 5218 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 TBC1D23-209ENST00000496167 568 ntTSL 511.63□□□□□ -0.554e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 ATF7-201ENST00000420353 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 NUMB-206ENST00000553415 694 ntTSL 410.98□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 PGM2-201ENST00000381967 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.674e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 ANKZF1-209ENST00000460966 873 ntTSL 1 (best)10.68□□□□□ -0.74e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 DNMT1-206ENST00000586086 489 ntTSL 310.45□□□□□ -0.744e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 FNDC3B-208ENST00000476794 682 ntTSL 39.97□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 KLC1-215ENST00000553680 519 ntTSL 29.31□□□□□ -0.924e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 MAPK3-208ENST00000473431 368 ntTSL 29.11□□□□□ -0.954e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.994e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 RHOBTB3-210ENST00000510313 990 ntTSL 28.77□□□□□ -1.014e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC8.36□□□□□ -1.074e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 PGM2-204ENST00000512556 2050 ntTSL 28.18□□□□□ -1.14e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.174e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 RMND5A-202ENST00000466417 486 ntTSL 57.59□□□□□ -1.194e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 DNMT1-210ENST00000586800 583 ntTSL 37.48□□□□□ -1.214e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 ARPC3-209ENST00000549408 209 ntTSL 57.39□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 PCMT1-206ENST00000480010 377 ntTSL 57.17□□□□□ -1.264e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.454e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.584e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 FNDC3B-209ENST00000478016 554 ntTSL 45.13□□□□□ -1.593e-6■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.594e-8■■■■■ 30.8
UTP3Q9NQZ2 RNA5SP444-201ENST00000516844 106 ntBASIC11.07□□□□□ -0.644e-11■■■■■ 30.7
UTP3Q9NQZ2 VPS28-206ENST00000526734 570 ntTSL 221.83■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 30.7
UTP3Q9NQZ2 VPS28-211ENST00000530790 561 ntTSL 214.14□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 30.7
UTP3Q9NQZ2 FXR1-216ENST00000482125 739 ntTSL 58.92□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 30.7
UTP3Q9NQZ2 ZFAS1-207ENST00000458653 596 ntTSL 230.31■■■□□ 2.443e-6■■■■■ 30.7
UTP3Q9NQZ2 ZFAS1-202ENST00000371743 1008 ntTSL 1 (best)26.74■■□□□ 1.873e-6■■■■■ 30.7
UTP3Q9NQZ2 ZFAS1-203ENST00000417721 860 ntTSL 1 (best)25.39■■□□□ 1.663e-6■■■■■ 30.7
UTP3Q9NQZ2 ZFAS1-205ENST00000441722 946 ntTSL 1 (best)23.24■■□□□ 1.313e-6■■■■■ 30.7
UTP3Q9NQZ2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.313e-6■■■■■ 30.7
UTP3Q9NQZ2 ZFAS1-204ENST00000428008 566 ntTSL 28.73□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 30.7
UTP3Q9NQZ2 ZFAS1-209ENST00000620594 508 ntTSL 38.68□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 30.7
UTP3Q9NQZ2 ZFAS1-201ENST00000326677 504 ntTSL 1 (best)7.66□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 30.7
UTP3Q9NQZ2 AARS-202ENST00000564359 590 ntTSL 310.82□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 30.7
UTP3Q9NQZ2 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 30.6
UTP3Q9NQZ2 HIST1H2BC-202ENST00000396984 571 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.542e-17■■■■■ 30.6
UTP3Q9NQZ2 RBM14-207ENST00000461478 693 ntTSL 222.32■■□□□ 1.162e-8■■■■■ 30.6
UTP3Q9NQZ2 CTDSP2-202ENST00000547169 1340 ntTSL 216.71■□□□□ 0.271e-12■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 CTDSP2-205ENST00000549039 797 ntTSL 212.86□□□□□ -0.351e-12■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 CYC1-204ENST00000533444 1832 ntTSL 1 (best)28.8■■■□□ 2.24e-8■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.274e-8■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 FUS-205ENST00000487045 952 ntTSL 212.43□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 SREK1-206ENST00000519259 9353 ntTSL 24.14□□□□□ -1.757e-7■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 DDX17-206ENST00000467279 712 ntTSL 525.19■■□□□ 1.621e-7■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 PIEZO1-207ENST00000475586 560 ntTSL 420.58■□□□□ 0.897e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 ACADVL-232ENST00000583074 410 ntTSL 519.7■□□□□ 0.747e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 ACADVL-209ENST00000578033 562 ntTSL 219.33■□□□□ 0.687e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 ACADVL-236ENST00000583850 903 ntTSL 219.14■□□□□ 0.657e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.397e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.387e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.367e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 SF3B2-202ENST00000524475 432 ntTSL 316.07■□□□□ 0.167e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 07e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 ACADVL-215ENST00000578809 709 ntTSL 214.6□□□□□ -0.077e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 ACADVL-211ENST00000578319 718 ntTSL 313.74□□□□□ -0.217e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 CTTN-210ENST00000525852 1470 ntTSL 513.22□□□□□ -0.297e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 ACADVL-235ENST00000583848 503 ntTSL 313.16□□□□□ -0.37e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 DDX17-205ENST00000432525 1354 ntTSL 211.47□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 NUP98-205ENST00000397007 3698 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.627e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 PPP4R1-224ENST00000583092 554 ntTSL 410.88□□□□□ -0.677e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 RPL7L1-208ENST00000493763 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.947e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 NUP98-216ENST00000529379 536 ntTSL 39.09□□□□□ -0.957e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.987e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 NUP98-206ENST00000397013 939 ntTSL 58.58□□□□□ -1.047e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 NUP98-214ENST00000527104 705 ntTSL 37.94□□□□□ -1.147e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.227e-10■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 FAM193B-210ENST00000507587 825 ntTSL 219.12■□□□□ 0.658e-7■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 NUP214-215ENST00000525980 2274 ntTSL 29.48□□□□□ -0.891e-8■■■■■ 30.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF672-205ENST00000505503 583 ntTSL 320.79■□□□□ 0.927e-7■■■■■ 30.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.437e-7■■■■■ 30.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF672-203ENST00000428515 930 ntTSL 214.68□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 30.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF672-206ENST00000510904 555 ntTSL 413.27□□□□□ -0.297e-7■■■■■ 30.4
UTP3Q9NQZ2 LMNA-217ENST00000498722 1348 ntTSL 217.24■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 30.4
UTP3Q9NQZ2 RACK1-230ENST00000513060 1651 ntTSL 514.73□□□□□ -0.056e-11■■■■■ 30.4
UTP3Q9NQZ2 RACK1-226ENST00000511900 922 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.576e-11■■■■■ 30.4
UTP3Q9NQZ2 RACK1-227ENST00000512805 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.616e-11■■■■■ 30.4
UTP3Q9NQZ2 RACK1-219ENST00000508682 1208 ntTSL 510.52□□□□□ -0.736e-11■■■■■ 30.4
UTP3Q9NQZ2 RACK1-224ENST00000511473 1150 ntTSL 510.33□□□□□ -0.766e-11■■■■■ 30.4
UTP3Q9NQZ2 RACK1-225ENST00000511566 825 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.766e-11■■■■■ 30.4
UTP3Q9NQZ2 RACK1-210ENST00000504325 1098 ntTSL 1 (best)10.04□□□□□ -0.86e-11■■■■■ 30.4
UTP3Q9NQZ2 RACK1-228ENST00000512968 1058 ntTSL 59.6□□□□□ -0.876e-11■■■■■ 30.4
UTP3Q9NQZ2 RACK1-211ENST00000504726 388 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.946e-11■■■■■ 30.4
UTP3Q9NQZ2 RACK1-201ENST00000376817 965 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.986e-11■■■■■ 30.4
UTP3Q9NQZ2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.18■□□□□ 0.983e-7■■■■■ 30.3
UTP3Q9NQZ2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.783e-7■■■■■ 30.3
UTP3Q9NQZ2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.743e-7■■■■■ 30.3
UTP3Q9NQZ2 TYK2-219ENST00000533334 725 ntTSL 318.32■□□□□ 0.523e-7■■■■■ 30.3
UTP3Q9NQZ2 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 30.3
UTP3Q9NQZ2 TYK2-217ENST00000531620 586 ntTSL 315.46■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 30.3
UTP3Q9NQZ2 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.063e-7■■■■■ 30.3
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