Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1BQ9H816 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms