Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms