Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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