Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.053e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ACADM-204ENST00000473018 579 ntTSL 214.6□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ACADM-215ENST00000532509 825 ntTSL 514.6□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ACADM-216ENST00000534146 654 ntTSL 414.24□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 USP3-205ENST00000557884 958 ntTSL 314.17□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 USP3-221ENST00000561442 542 ntTSL 514.17□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 C7orf26-205ENST00000472693 1006 ntTSL 514.14□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ACADM-213ENST00000530953 508 ntTSL 514.09□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 POLG2-210ENST00000585141 1731 ntTSL 1 (best)14.08□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-207ENST00000449811 567 ntTSL 413.73□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.232e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.32e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.322e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.342e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 AK2-212ENST00000550338 886 ntTSL 212.79□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 SFXN5-212ENST00000475630 422 ntTSL 312.78□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.382e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.382e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.45e-8■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 WIPF2-209ENST00000584296 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 412.51□□□□□ -0.412e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CCDC85C-202ENST00000554877 543 ntTSL 412.28□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 DCP1A-204ENST00000560076 625 ntTSL 312.15□□□□□ -0.462e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-223ENST00000544669 1800 ntTSL 512.11□□□□□ -0.472e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ACADM-207ENST00000525881 914 ntTSL 211.99□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 POLR3E-208ENST00000564061 4800 ntTSL 1 (best)11.98□□□□□ -0.495e-17■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CYTOR-202ENST00000409054 1096 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.59e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 SNX8-204ENST00000435336 634 ntTSL 511.91□□□□□ -0.52e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CYTOR-201ENST00000331944 529 ntTSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.529e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.522e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-211ENST00000477890 1234 ntTSL 511.76□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 AK2-206ENST00000480134 811 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 FBXO11-209ENST00000492225 2216 ntTSL 1 (best)11.61□□□□□ -0.552e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ACADM-208ENST00000526129 1536 ntTSL 211.53□□□□□ -0.562e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CYTOR-209ENST00000423846 457 ntTSL 1 (best)11.49□□□□□ -0.579e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CCDC85C-205ENST00000556348 556 ntTSL 511.43□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 USP3-202ENST00000380324 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.592e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 BTAF1-201ENST00000265990 7250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.591e-8■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 SNX8-205ENST00000447136 583 ntTSL 311.27□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-218ENST00000537641 1728 ntTSL 511.21□□□□□ -0.622e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 DCP1A-205ENST00000560624 849 ntTSL 311.18□□□□□ -0.622e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CYTOR-211ENST00000455131 733 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.659e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-212ENST00000489728 488 ntTSL 410.98□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CYTOR-208ENST00000419680 675 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.659e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 STAG3L4-202ENST00000416602 2143 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CCDC85C-203ENST00000554996 619 ntTSL 410.24□□□□□ -0.772e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CHEK2-219ENST00000448511 1532 ntTSL 210.23□□□□□ -0.772e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CHEK2-208ENST00000404276 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 TRPM7-207ENST00000560955 7218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 AK2-215ENST00000629371 3576 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CHEK2-207ENST00000403642 1359 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.82e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 USP3-219ENST00000561326 543 ntTSL 410.04□□□□□ -0.82e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ZRANB3-205ENST00000452187 1269 ntTSL 510.03□□□□□ -0.83e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CAPZA1-205ENST00000485542 739 ntTSL 210.02□□□□□ -0.812e-6■■■■□ 21.5
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ILF3Q12906 USP3-216ENST00000559873 584 ntTSL 59.98□□□□□ -0.812e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 AK2-202ENST00000373449 3586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.822e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 DIP2A-202ENST00000417564 6967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.832e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CHEK2-221ENST00000456369 588 ntTSL 39.8□□□□□ -0.842e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CHEK2-214ENST00000433728 1580 ntTSL 29.57□□□□□ -0.882e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CHEK2-211ENST00000417588 1551 ntTSL 29.57□□□□□ -0.882e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-217ENST00000537162 801 ntTSL 39.45□□□□□ -0.92e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 AK2-211ENST00000548559 530 ntTSL 49.33□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ZNF138-202ENST00000359735 2679 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CHEK2-215ENST00000434810 984 ntTSL 39.15□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 RBMX-212ENST00000568578 4887 ntTSL 1 (best)9.13□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ZRANB3-208ENST00000492193 546 ntTSL 39.02□□□□□ -0.973e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 TFDP2-209ENST00000477292 1403 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CHEK2-206ENST00000402731 1545 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -12e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-226ENST00000626926 306 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.012e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ACADM-217ENST00000534334 1149 ntTSL 1 (best)8.69□□□□□ -1.022e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 USP3-217ENST00000560070 545 ntTSL 48.47□□□□□ -1.052e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.081e-11■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 RASSF3-206ENST00000637125 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.132e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 TFDP2-206ENST00000474279 379 ntTSL 27.88□□□□□ -1.152e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 TFDP2-213ENST00000487734 1469 ntTSL 57.86□□□□□ -1.152e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-206ENST00000448745 1749 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.162e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.172e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 TFDP2-222ENST00000495310 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.192e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.192e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 DCP1A-201ENST00000294241 1853 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.192e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-214ENST00000535222 940 ntTSL 37.46□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-224ENST00000544990 646 ntTSL 37.32□□□□□ -1.242e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.259e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-216ENST00000536548 598 ntTSL 47.18□□□□□ -1.262e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.272e-6■■■■□ 21.5
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