Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMTP48728 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMTP48728 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMTP48728 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMTP48728 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMTP48728 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMTP48728 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMTP48728 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMTP48728 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMTP48728 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMTP48728 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMTP48728 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMTP48728 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMTP48728 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMTP48728 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMTP48728 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMTP48728 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMTP48728 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMTP48728 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMTP48728 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMTP48728 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMTP48728 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AMTP48728 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMTP48728 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AMTP48728 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMTP48728 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMTP48728 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMTP48728 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMTP48728 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMTP48728 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMTP48728 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMTP48728 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AMTP48728 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AMTP48728 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AMTP48728 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AMTP48728 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AMTP48728 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AMTP48728 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMTP48728 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMTP48728 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMTP48728 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMTP48728 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMTP48728 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMTP48728 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMTP48728 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMTP48728 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMTP48728 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMTP48728 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMTP48728 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMTP48728 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMTP48728 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMTP48728 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMTP48728 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMTP48728 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMTP48728 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AMTP48728 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AMTP48728 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AMTP48728 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AMTP48728 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AMTP48728 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AMTP48728 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AMTP48728 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AMTP48728 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AMTP48728 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
AMTP48728 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AMTP48728 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AMTP48728 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AMTP48728 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms