Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTX1P32242 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OTX1P32242 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTX1P32242 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTX1P32242 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTX1P32242 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTX1P32242 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTX1P32242 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTX1P32242 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTX1P32242 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTX1P32242 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX1P32242 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX1P32242 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX1P32242 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX1P32242 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX1P32242 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX1P32242 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX1P32242 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX1P32242 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX1P32242 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX1P32242 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX1P32242 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX1P32242 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX1P32242 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX1P32242 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX1P32242 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX1P32242 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX1P32242 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX1P32242 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX1P32242 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX1P32242 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX1P32242 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX1P32242 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX1P32242 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX1P32242 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX1P32242 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX1P32242 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX1P32242 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX1P32242 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX1P32242 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX1P32242 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX1P32242 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX1P32242 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX1P32242 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX1P32242 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX1P32242 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX1P32242 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX1P32242 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX1P32242 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX1P32242 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX1P32242 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX1P32242 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX1P32242 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX1P32242 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTX1P32242 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTX1P32242 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTX1P32242 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX1P32242 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX1P32242 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX1P32242 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX1P32242 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX1P32242 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX1P32242 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX1P32242 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX1P32242 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX1P32242 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX1P32242 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX1P32242 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX1P32242 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX1P32242 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX1P32242 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX1P32242 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX1P32242 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX1P32242 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX1P32242 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX1P32242 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX1P32242 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX1P32242 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX1P32242 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX1P32242 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX1P32242 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX1P32242 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX1P32242 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX1P32242 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX1P32242 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX1P32242 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX1P32242 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX1P32242 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX1P32242 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX1P32242 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX1P32242 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX1P32242 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX1P32242 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX1P32242 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX1P32242 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX1P32242 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX1P32242 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX1P32242 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX1P32242 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX1P32242 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms