Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 HDHD3-203ENST00000485934 913 ntTSL 214.82□□□□□ -0.047e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 LMAN2L-206ENST00000446780 1400 ntTSL 214.75□□□□□ -0.057e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.067e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.067e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.077e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 NR1H3-222ENST00000483882 572 ntTSL 214.57□□□□□ -0.087e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.17e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 LMAN2L-204ENST00000434865 1163 ntTSL 214.26□□□□□ -0.137e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 FAM45A-205ENST00000487888 851 ntTSL 214.19□□□□□ -0.147e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 LMAN2L-205ENST00000440610 1008 ntTSL 213.8□□□□□ -0.27e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 LMAN2L-207ENST00000449221 1061 ntTSL 213.8□□□□□ -0.27e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.217e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SLC25A30-201ENST00000310862 1094 ntTSL 1 (best)13.57□□□□□ -0.247e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 FAM45A-208ENST00000493766 824 ntTSL 313.34□□□□□ -0.277e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 FAM45A-202ENST00000448258 692 ntTSL 313.18□□□□□ -0.37e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 FAM45A-209ENST00000497903 699 ntTSL 213.18□□□□□ -0.37e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.327e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 ZNF76-206ENST00000479226 891 ntTSL 212.79□□□□□ -0.367e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SLC25A30-207ENST00000539591 3608 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.367e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 LMAN2L-203ENST00000434524 2410 ntTSL 512.54□□□□□ -0.47e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.477e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.487e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 FAM45A-204ENST00000472379 984 ntTSL 212.02□□□□□ -0.497e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 GGPS1-205ENST00000482013 470 ntTSL 411.89□□□□□ -0.517e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CAP2-204ENST00000476263 891 ntTSL 511.87□□□□□ -0.517e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 GGPS1-207ENST00000489692 506 ntTSL 311.67□□□□□ -0.547e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CAP2-201ENST00000229922 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.557e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 GGPS1-201ENST00000282841 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.67e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CAP2-207ENST00000493172 861 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.647e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CCNI-202ENST00000504697 610 ntTSL 410.42□□□□□ -0.747e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CRIM1-202ENST00000413985 874 ntTSL 39.79□□□□□ -0.847e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CAP2-205ENST00000479291 1378 ntTSL 1 (best)9.78□□□□□ -0.847e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 GGPS1-204ENST00000471812 850 ntTSL 29.03□□□□□ -0.967e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 FGD4-206ENST00000493087 2987 ntTSL 28.22□□□□□ -1.097e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.117e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CAP2-203ENST00000465994 1404 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.147e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CCNI-207ENST00000513774 517 ntTSL 47.59□□□□□ -1.197e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 ENTPD5-202ENST00000553284 904 ntTSL 37.44□□□□□ -1.221e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CCNI-203ENST00000505609 541 ntTSL 46.71□□□□□ -1.347e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 FGD4-208ENST00000494977 2349 ntTSL 26.59□□□□□ -1.357e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 FGD4-215ENST00000551984 2435 ntTSL 56.45□□□□□ -1.387e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.387e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SEPT7-217ENST00000635175 1464 ntTSL 25.86□□□□□ -1.477e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 FGD4-201ENST00000395740 2691 ntTSL 1 (best)5.24□□□□□ -1.577e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 NCL-208ENST00000466274 671 ntTSL 25.2□□□□□ -1.587e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.637e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SEPT7-208ENST00000475109 733 ntTSL 54.78□□□□□ -1.647e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SEPT7-215ENST00000635047 760 ntTSL 44.57□□□□□ -1.687e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.737e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.757e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SEPT7-211ENST00000493626 643 ntTSL 43.96□□□□□ -1.787e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SEPT7-220ENST00000635669 569 ntTSL 43.42□□□□□ -1.867e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SEPT7-213ENST00000634600 583 ntTSL 22.56□□□□□ -27e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 NELFCD-208ENST00000482747 1701 ntTSL 216.32■□□□□ 0.22e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.18□□□□□ -2.385e-23■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 NR1H3-207ENST00000420369 780 ntTSL 318.9■□□□□ 0.623e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 NR1H3-219ENST00000476086 588 ntTSL 218.83■□□□□ 0.63e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 NR1H3-209ENST00000436778 802 ntTSL 318.27■□□□□ 0.523e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 NR1H3-212ENST00000444396 784 ntTSL 318.27■□□□□ 0.523e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 NR1H3-214ENST00000457932 552 ntTSL 518.27■□□□□ 0.523e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 NR1H3-208ENST00000436029 911 ntTSL 517.35■□□□□ 0.373e-7■□□□□ 9.7
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EFTUD2Q15029 NR1H3-213ENST00000449369 825 ntTSL 513.57□□□□□ -0.243e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 NR1H3-215ENST00000461778 726 ntTSL 513.37□□□□□ -0.273e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SLC22A31-205ENST00000603735 791 ntTSL 316.94■□□□□ 0.33e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 NR1H3-223ENST00000486991 539 ntTSL 412.86□□□□□ -0.356e-8■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 RBM19-205ENST00000552384 588 ntTSL 320.7■□□□□ 0.95e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 LUC7L-209ENST00000429378 721 ntTSL 316.27■□□□□ 0.21e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 LUC7L-213ENST00000464711 2134 ntTSL 216.13■□□□□ 0.171e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 KEL-206ENST00000476829 649 ntTSL 314.41□□□□□ -0.11e-14■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 KEL-208ENST00000479768 1856 ntTSL 513.92□□□□□ -0.181e-14■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 LUC7L-220ENST00000495349 1006 ntTSL 213.58□□□□□ -0.241e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 KEL-209ENST00000494148 417 ntTSL 311.06□□□□□ -0.641e-14■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ANAPC5-202ENST00000366333 923 ntTSL 210.39□□□□□ -0.751e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 KEL-201ENST00000355265 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.921e-14■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 NUP160-210ENST00000531016 634 ntTSL 37.64□□□□□ -1.191e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ZC3H15-205ENST00000468120 601 ntTSL 45.6□□□□□ -1.511e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ARIH2-214ENST00000469038 407 ntTSL 35.02□□□□□ -1.611e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 RAB5A-206ENST00000469122 918 ntTSL 24.22□□□□□ -1.731e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 EIF5-219ENST00000561380 926 ntTSL 53.95□□□□□ -1.782e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ZC3H15-207ENST00000481101 558 ntTSL 43.7□□□□□ -1.821e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 RAB5A-207ENST00000473608 868 ntTSL 23.63□□□□□ -1.831e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ZC3H15-208ENST00000496289 554 ntTSL 52.7□□□□□ -1.981e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 WDR59-215ENST00000568462 550 ntTSL 45.38□□□□□ -1.552e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ELL2-207ENST00000515020 340 ntTSL 223.43■■□□□ 1.341e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ELL2-208ENST00000635633 467 ntTSL 35.3□□□□□ -1.561e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ZFP90-207ENST00000569109 538 ntTSL 419.29■□□□□ 0.684e-7■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ZFP90-211ENST00000571382 717 ntTSL 516.49■□□□□ 0.234e-7■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ZFP90-217ENST00000576305 579 ntTSL 414.83□□□□□ -0.044e-7■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.124e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 04e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 EML4-202ENST00000401738 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.694e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-248ENST00000524179 598 ntTSL 214.45□□□□□ -0.13e-19■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 BOD1-204ENST00000471339 688 ntTSL 421.9■■□□□ 1.14e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 GPRC5C-210ENST00000582473 584 ntTSL 319.47■□□□□ 0.714e-8■□□□□ 9.6
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