Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SERP1Q9Y6X1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms