Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.231e-7■■■■■ 30.8
RBM22Q9NW64 HSPA9-206ENST00000506477 664 ntTSL 216.97■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 30.8
RBM22Q9NW64 HSPA9-205ENST00000505110 518 ntTSL 414.97□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 30.8
RBM22Q9NW64 HSPA9-208ENST00000507115 663 ntTSL 39.92□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 30.8
RBM22Q9NW64 HSPA9-203ENST00000504810 584 ntTSL 36.08□□□□□ -1.443e-6■■■■■ 30.8
RBM22Q9NW64 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.497e-7■■■■■ 30.8
RBM22Q9NW64 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.97e-7■■■■■ 30.8
RBM22Q9NW64 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.641e-8■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 AKAP8L-203ENST00000594594 2251 ntTSL 522.83■■□□□ 1.241e-8■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 ANKRD17-210ENST00000561029 2717 ntTSL 521.64■■□□□ 1.051e-6■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.791e-8■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 AKAP8L-220ENST00000609519 2113 ntTSL 219.88■□□□□ 0.771e-8■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 AKAP8L-209ENST00000595879 790 ntTSL 318.9■□□□□ 0.622e-11■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 AKAP8L-202ENST00000593845 2749 ntTSL 218.22■□□□□ 0.511e-8■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 ITGB1-215ENST00000488494 540 ntTSL 417.79■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 RNF168-202ENST00000437070 2202 ntTSL 217.68■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 ITGB1-210ENST00000474568 788 ntTSL 516.12■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 ITGB1-204ENST00000417122 569 ntTSL 415.68■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 ITGB1-211ENST00000475184 552 ntTSL 415.6■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 VCL-205ENST00000478896 727 ntTSL 513.15□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 ITGB1-202ENST00000396033 3784 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 CAPZA2-201ENST00000361183 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.043e-6■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 ITGB1-218ENST00000528877 546 ntTSL 47.03□□□□□ -1.282e-7■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.321e-6■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.412e-7■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 ANKRD17-207ENST00000558247 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.14□□□□□ -1.431e-6■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 ITGB1-209ENST00000472147 668 ntTSL 35.65□□□□□ -1.53e-6■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 ANKRD17-206ENST00000514252 3259 ntTSL 24.98□□□□□ -1.611e-6■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.683e-6■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 ITGB1-219ENST00000534049 562 ntTSL 43.64□□□□□ -1.832e-7■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 U2SURP-205ENST00000467348 1267 ntTSL 53.56□□□□□ -1.843e-6■■■■■ 30.7
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RBM22Q9NW64 ITGB1-212ENST00000480226 585 ntTSL 42.79□□□□□ -1.963e-6■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 ITGB1-206ENST00000437302 445 ntTSL 52.58□□□□□ -23e-6■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 CD46-213ENST00000471987 572 ntTSL 32.25□□□□□ -2.051e-13■■■■■ 30.7
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RBM22Q9NW64 ITGB1-216ENST00000493758 366 ntTSL 31.28□□□□□ -2.23e-6■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.145e-7■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 XPO1-206ENST00000428210 6776 ntTSL 213.79□□□□□ -0.25e-7■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.995e-7■■■■■ 30.7
RBM22Q9NW64 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.2■□□□□ 0.183e-7■■■■■ 30.7
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RBM22Q9NW64 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.492e-15■■■■■ 30.6
RBM22Q9NW64 ATP11A-210ENST00000471555 5786 ntTSL 1 (best)11.54□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 30.6
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RBM22Q9NW64 SEC13-210ENST00000428626 567 ntTSL 315.46■□□□□ 0.073e-13■■■■■ 30.5
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RBM22Q9NW64 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.157e-11■■■■■ 30.5
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RBM22Q9NW64 SEC13-211ENST00000431352 832 ntTSL 513.82□□□□□ -0.27e-11■■■■■ 30.5
RBM22Q9NW64 SEC13-205ENST00000397101 592 ntTSL 213.65□□□□□ -0.227e-11■■■■■ 30.5
RBM22Q9NW64 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.267e-11■■■■■ 30.5
RBM22Q9NW64 LUC7L-209ENST00000429378 721 ntTSL 317.35■□□□□ 0.374e-10■■■■■ 30.5
RBM22Q9NW64 LUC7L-213ENST00000464711 2134 ntTSL 215.55■□□□□ 0.084e-10■■■■■ 30.5
RBM22Q9NW64 LUC7L-220ENST00000495349 1006 ntTSL 213.94□□□□□ -0.184e-10■■■■■ 30.5
RBM22Q9NW64 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.374e-10■■■■■ 30.5
RBM22Q9NW64 CTTN-204ENST00000393747 1315 ntTSL 517.95■□□□□ 0.462e-7■■■■■ 30.5
RBM22Q9NW64 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 30.5
RBM22Q9NW64 MAGI1-206ENST00000468159 972 ntTSL 1 (best)19.35■□□□□ 0.696e-10■■■■■ 30.5
RBM22Q9NW64 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.844e-7■■■■■ 30.5
RBM22Q9NW64 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 30.5
RBM22Q9NW64 GOLGA4-201ENST00000356847 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.524e-7■■■■■ 30.5
RBM22Q9NW64 HSPD1-209ENST00000452200 888 ntTSL 58.78□□□□□ -13e-8■■■■■ 30.5
RBM22Q9NW64 HSPD1-206ENST00000430176 754 ntTSL 55.26□□□□□ -1.573e-8■■■■■ 30.5
RBM22Q9NW64 IGF2BP3-202ENST00000421467 2988 ntTSL 59.32□□□□□ -0.926e-11■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.316e-11■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 HNRNPU-220ENST00000639667 3940 ntTSL 25.93□□□□□ -1.461e-13■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.925e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 TMEM161A-204ENST00000587096 1065 ntTSL 518.65■□□□□ 0.585e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 CCHCR1-228ENST00000509552 2304 ntTSL 1 (best)18.16■□□□□ 0.55e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 TMEM161A-209ENST00000587985 1754 ntTSL 518.12■□□□□ 0.495e-6■■■■■ 30.4
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