Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 HNRNPK-206ENST00000457156 1283 ntTSL 528.12■■■□□ 2.091e-9■■■■□ 22.8
DROSHAQ9NRR4 HNRNPK-209ENST00000483135 900 ntTSL 29.77□□□□□ -0.841e-9■■■■□ 22.8
DROSHAQ9NRR4 HNRNPK-207ENST00000472778 822 ntTSL 39.77□□□□□ -0.841e-9■■■■□ 22.8
DROSHAQ9NRR4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.082e-6■■■■□ 22.8
DROSHAQ9NRR4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.722e-6■■■■□ 22.8
DROSHAQ9NRR4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.717e-7■■■■□ 22.8
DROSHAQ9NRR4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.697e-7■■■■□ 22.8
DROSHAQ9NRR4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.587e-7■■■■□ 22.8
DROSHAQ9NRR4 PQLC1-206ENST00000474967 2319 ntTSL 528.81■■■□□ 2.27e-7■■■■□ 22.8
DROSHAQ9NRR4 PQLC1-201ENST00000351365 2414 ntTSL 226.15■■□□□ 1.787e-7■■■■□ 22.8
DROSHAQ9NRR4 PQLC1-204ENST00000466449 2887 ntTSL 224.04■■□□□ 1.447e-7■■■■□ 22.8
DROSHAQ9NRR4 PQLC1-205ENST00000469369 593 ntTSL 420.94■□□□□ 0.947e-7■■■■□ 22.8
DROSHAQ9NRR4 PQLC1-209ENST00000589000 558 ntTSL 417.94■□□□□ 0.467e-7■■■■□ 22.8
DROSHAQ9NRR4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.692e-10■■■■□ 22.8
DROSHAQ9NRR4 MANF-201ENST00000446668 846 ntTSL 331.86■■■□□ 2.692e-10■■■■□ 22.8
DROSHAQ9NRR4 FGFR3-209ENST00000507588 336 ntTSL 1 (best)28.99■■■□□ 2.231e-13■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 CHM-202ENST00000467744 2040 ntTSL 57.43□□□□□ -1.222e-7■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.362e-7■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 CBFA2T3-203ENST00000562719 539 ntTSL 516.16■□□□□ 0.182e-6■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.031e-7■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.911e-7■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 NDUFB6-201ENST00000350021 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.151e-7■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 CTBP1-207ENST00000505826 657 ntTSL 526.33■■□□□ 1.86e-10■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 SEC62-203ENST00000461933 363 ntTSL 220.21■□□□□ 0.832e-6■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 SEC62-207ENST00000480708 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.352e-6■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.752e-6■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 SEC62-204ENST00000469515 785 ntTSL 39.26□□□□□ -0.932e-6■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 SEC62-209ENST00000487736 508 ntTSL 53.31□□□□□ -1.882e-6■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 SEC62-208ENST00000481435 627 ntTSL 22.87□□□□□ -1.952e-6■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 SEC62-202ENST00000460513 641 ntTSL 52.67□□□□□ -1.982e-6■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.012e-11■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.072e-11■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 ATXN2L-210ENST00000562867 609 ntTSL 227.77■■■□□ 2.044e-7■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.33e-18■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 SON-206ENST00000429093 684 ntTSL 520.17■□□□□ 0.822e-8■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 SON-208ENST00000455528 8394 ntTSL 1 (best)12.93□□□□□ -0.342e-8■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.52e-8■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 SON-209ENST00000457208 765 ntTSL 311.06□□□□□ -0.642e-8■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 SON-207ENST00000436227 5269 ntAPPRIS P1 TSL 510.3□□□□□ -0.762e-8■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.072e-8■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 SON-211ENST00000467616 676 ntTSL 57.84□□□□□ -1.162e-8■■■■□ 22.7
DROSHAQ9NRR4 GET4-207ENST00000483469 370 ntTSL 228.32■■■□□ 2.122e-8■■■■□ 22.6
DROSHAQ9NRR4 GET4-204ENST00000426056 502 ntTSL 416.56■□□□□ 0.242e-8■■■■□ 22.6
DROSHAQ9NRR4 GIPR-207ENST00000591322 557 ntTSL 425.3■■□□□ 1.645e-14■■■■□ 22.6
DROSHAQ9NRR4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.78e-7■■■■□ 22.6
DROSHAQ9NRR4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.258e-7■■■■□ 22.6
DROSHAQ9NRR4 PTMS-206ENST00000540874 501 ntTSL 228.4■■■□□ 2.148e-7■■■■□ 22.6
DROSHAQ9NRR4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.728e-7■■■■□ 22.6
DROSHAQ9NRR4 PTMS-204ENST00000540667 820 ntTSL 222.55■■□□□ 1.28e-7■■■■□ 22.6
DROSHAQ9NRR4 CTBP2-206ENST00000460976 603 ntTSL 540.77■■■■■ 4.121e-6■■■■□ 22.6
DROSHAQ9NRR4 CTBP2-207ENST00000467395 410 ntTSL 337.98■■■■□ 3.671e-6■■■■□ 22.6
DROSHAQ9NRR4 NFIC-208ENST00000589537 977 ntTSL 225.53■■□□□ 1.682e-6■■■■□ 22.6
DROSHAQ9NRR4 FKBP2-205ENST00000536642 637 ntTSL 230.32■■■□□ 2.442e-6■■■■□ 22.6
DROSHAQ9NRR4 FKBP2-206ENST00000541388 705 ntTSL 529.82■■■□□ 2.362e-6■■■■□ 22.6
DROSHAQ9NRR4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.582e-6■■■■□ 22.6
DROSHAQ9NRR4 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 22.6
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-213ENST00000444651 847 ntTSL 321.57■■□□□ 1.042e-7■■■■□ 22.6
DROSHAQ9NRR4 NSD2-218ENST00000508355 2092 ntTSL 1 (best)21.06■□□□□ 0.961e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 NSD2-216ENST00000507820 528 ntTSL 519.92■□□□□ 0.781e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.61e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.312e-7■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 REPIN1-205ENST00000467980 899 ntTSL 340.58■■■■■ 4.093e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.023e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 REPIN1-206ENST00000469309 910 ntTSL 238.35■■■■□ 3.733e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 REPIN1-215ENST00000495535 672 ntTSL 335.95■■■■□ 3.353e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 REPIN1-219ENST00000522266 480 ntTSL 235.95■■■■□ 3.353e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 REPIN1-213ENST00000488943 1262 ntTSL 532.79■■■□□ 2.843e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.813e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 REPIN1-208ENST00000475514 1192 ntTSL 532.36■■■□□ 2.773e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 REPIN1-207ENST00000473391 1064 ntTSL 232.17■■■□□ 2.743e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.521e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.372e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.333e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.313e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-208ENST00000520872 560 ntTSL 329.21■■■□□ 2.272e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 REPIN1-216ENST00000518462 621 ntTSL 427.76■■■□□ 2.033e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.563e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 REPIN1-218ENST00000519397 583 ntTSL 424.7■■□□□ 1.553e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.362e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-204ENST00000518767 1146 ntTSL 1 (best)23.04■■□□□ 1.282e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.033e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 13e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 REPIN1-211ENST00000486714 824 ntTSL 521.26■□□□□ 0.993e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-203ENST00000518502 687 ntTSL 319.44■□□□□ 0.72e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.72e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-228ENST00000524191 808 ntTSL 319.2■□□□□ 0.662e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-202ENST00000517542 1695 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.382e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-214ENST00000521451 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.362e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 REPIN1-212ENST00000487455 464 ntTSL 415.22■□□□□ 0.033e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-215ENST00000521727 3953 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.272e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-226ENST00000524104 2173 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.52e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-205ENST00000518981 1746 ntTSL 29.2□□□□□ -0.942e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-206ENST00000519818 590 ntTSL 48.9□□□□□ -0.982e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-213ENST00000521447 727 ntTSL 57.9□□□□□ -1.142e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-222ENST00000522962 1041 ntTSL 37.81□□□□□ -1.162e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.182e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-227ENST00000524113 658 ntTSL 27.6□□□□□ -1.192e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-216ENST00000521736 550 ntTSL 56.34□□□□□ -1.392e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-218ENST00000522061 564 ntTSL 46.32□□□□□ -1.42e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-217ENST00000521845 546 ntTSL 55.84□□□□□ -1.472e-8■■■■□ 22.5
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