Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A2Q12974 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTP4A2Q12974 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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