Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms