Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms