Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX2P28328 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX2P28328 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX2P28328 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX2P28328 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PEX2P28328 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PEX2P28328 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PEX2P28328 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX2P28328 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX2P28328 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX2P28328 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX2P28328 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX2P28328 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX2P28328 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX2P28328 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX2P28328 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX2P28328 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX2P28328 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX2P28328 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX2P28328 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX2P28328 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX2P28328 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX2P28328 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX2P28328 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX2P28328 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX2P28328 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX2P28328 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX2P28328 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX2P28328 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX2P28328 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX2P28328 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX2P28328 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX2P28328 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX2P28328 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX2P28328 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX2P28328 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX2P28328 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX2P28328 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PEX2P28328 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PEX2P28328 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PEX2P28328 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PEX2P28328 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PEX2P28328 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PEX2P28328 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PEX2P28328 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PEX2P28328 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PEX2P28328 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PEX2P28328 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PEX2P28328 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX2P28328 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX2P28328 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX2P28328 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX2P28328 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX2P28328 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX2P28328 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX2P28328 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX2P28328 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX2P28328 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX2P28328 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX2P28328 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX2P28328 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX2P28328 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX2P28328 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX2P28328 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX2P28328 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PEX2P28328 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PEX2P28328 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PEX2P28328 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PEX2P28328 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PEX2P28328 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PEX2P28328 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PEX2P28328 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PEX2P28328 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PEX2P28328 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PEX2P28328 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PEX2P28328 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PEX2P28328 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PEX2P28328 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PEX2P28328 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PEX2P28328 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms