Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 MFSD11-213ENST00000588670 834 ntTSL 515.44■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 MFSD11-214ENST00000588768 843 ntTSL 34.48□□□□□ -1.691e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 GON4L-202ENST00000361040 5118 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.449e-7■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 GON4L-207ENST00000467009 1831 ntTSL 210.33□□□□□ -0.769e-7■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.849e-7■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.849e-7■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.959e-7■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.979e-7■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.129e-7■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.139e-7■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 GON4L-209ENST00000471341 5097 ntTSL 28□□□□□ -1.139e-7■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.117e-29■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 CDYL-207ENST00000472453 1764 ntTSL 1 (best)29.58■■■□□ 2.331e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.831e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 CDYL-201ENST00000328908 3419 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 ANKMY2-202ENST00000421746 591 ntTSL 420.29■□□□□ 0.849e-10■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 ANKMY2-204ENST00000453623 587 ntTSL 411.56□□□□□ -0.569e-10■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.853e-7■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 NAB1-201ENST00000337386 4358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.763e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 STK40-208ENST00000482458 900 ntTSL 327.48■■□□□ 1.993e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 ATXN10-211ENST00000498009 873 ntTSL 525.54■■□□□ 1.683e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.643e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 DHX32-203ENST00000415732 803 ntTSL 324.7■■□□□ 1.543e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 KLHL24-203ENST00000437402 563 ntTSL 524.63■■□□□ 1.533e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 TRMU-204ENST00000441818 1793 ntTSL 1 (best)24.58■■□□□ 1.533e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 TTL-204ENST00000485537 1094 ntTSL 324.44■■□□□ 1.53e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 TRMU-207ENST00000457572 1882 ntTSL 224.08■■□□□ 1.453e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 SH2B3-203ENST00000550925 648 ntTSL 523.76■■□□□ 1.393e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 KLHL24-215ENST00000493074 627 ntTSL 423.54■■□□□ 1.363e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 KLHL24-212ENST00000481126 389 ntTSL 223.54■■□□□ 1.363e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 KLHL24-213ENST00000482138 588 ntTSL 423.54■■□□□ 1.363e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 TRMU-205ENST00000453630 1775 ntTSL 223.48■■□□□ 1.353e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 TRMU-203ENST00000381021 1830 ntTSL 223.33■■□□□ 1.333e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 TRMU-206ENST00000456595 1688 ntTSL 1 (best)23.21■■□□□ 1.313e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.273e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.253e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 KLHL24-204ENST00000454495 603 ntTSL 322.7■■□□□ 1.223e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 KLHL24-206ENST00000461813 587 ntTSL 422.27■■□□□ 1.163e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 KLHL24-202ENST00000427201 562 ntTSL 422.27■■□□□ 1.163e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 SLC39A9-208ENST00000556125 944 ntTSL 322.08■■□□□ 1.133e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 DMAP1-208ENST00000446292 1066 ntTSL 322.07■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.062e-12■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.033e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 CD55-209ENST00000488171 1389 ntTSL 321.45■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 KLHL24-209ENST00000473045 542 ntTSL 421.18■□□□□ 0.983e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.882e-12■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.879e-12■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 CLOCK-203ENST00000435527 746 ntTSL 320.36■□□□□ 0.853e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 PIK3CA-204ENST00000477735 245 ntTSL 420.08■□□□□ 0.813e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 WDR27-206ENST00000474018 951 ntTSL 219.58■□□□□ 0.723e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 KLHL24-208ENST00000468101 574 ntTSL 419.46■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 AC008575.2-203ENST00000512790 1850 ntTSL 219.37■□□□□ 0.693e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 TRMU-209ENST00000465378 610 ntTSL 419.36■□□□□ 0.693e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 COPS6-206ENST00000468499 745 ntTSL 319.23■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 TRMU-218ENST00000496831 576 ntTSL 419.07■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 CD55-202ENST00000343420 978 ntTSL 518.83■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 CC2D1A-205ENST00000588932 806 ntTSL 318.4■□□□□ 0.543e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 TRMU-215ENST00000486620 814 ntTSL 318.21■□□□□ 0.513e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 SLC23A3-206ENST00000430764 559 ntTSL 417.97■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 KLHL24-210ENST00000475827 545 ntTSL 417.66■□□□□ 0.429e-12■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 CLOCK-208ENST00000509151 476 ntTSL 417.59■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 DMAP1-207ENST00000440641 909 ntTSL 317.36■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 SLC23A3-202ENST00000409370 785 ntTSL 316.76■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 SLC23A3-205ENST00000421779 537 ntTSL 416.67■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 SLC23A3-209ENST00000465580 510 ntTSL 416.66■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 DMAP1-205ENST00000436069 599 ntTSL 316.64■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 RABGGTA-211ENST00000559850 534 ntTSL 316.63■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 NLRC5-221ENST00000543030 1894 ntTSL 516.22■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 UBAP1L-202ENST00000558802 640 ntTSL 516.08■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 FAN1-208ENST00000568145 851 ntTSL 315.86■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 SREBF2-202ENST00000424354 5699 ntTSL 1 (best)15.59■□□□□ 0.092e-12■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 EIF2B1-203ENST00000534960 618 ntTSL 515.58■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 ZDHHC18-204ENST00000488397 1275 ntTSL 215.44■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 SRP19-206ENST00000515463 660 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 FAN1-206ENST00000565280 4999 ntTSL 1 (best)15.15■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 DMAP1-211ENST00000475794 719 ntTSL 214.94□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 26.9
Retrieved 100 of 36,523 protein–RNA pairs in 253.4 ms