RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498009.5

ATXN10-211, Transcript of ataxin 10, humanhuman

TSL 5

Gene ATXN10, Length 873 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10-211ENST00000498009 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.82■■■■■ 6.05
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ATXN10-211ENST00000498009 ABCC9O60706 1549 aa45.01■■■■■ 4.8
ATXN10-211ENST00000498009 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.65
ATXN10-211ENST00000498009 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.04■■■■■ 4.64
ATXN10-211ENST00000498009 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.72■■■■■ 4.59
ATXN10-211ENST00000498009 NACADO15069 1562 aa43.7■■■■■ 4.59
ATXN10-211ENST00000498009 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.63■■■■■ 4.58
ATXN10-211ENST00000498009 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.58■■■■■ 4.57
ATXN10-211ENST00000498009 SCRIBQ14160 1630 aa42.62■■■■■ 4.41
ATXN10-211ENST00000498009 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.5■■■■■ 4.39
ATXN10-211ENST00000498009 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.26■■■■■ 4.36
ATXN10-211ENST00000498009 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.26■■■■■ 4.36
ATXN10-211ENST00000498009 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.18■■■■■ 4.34
ATXN10-211ENST00000498009 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.08■■■■■ 4.17
ATXN10-211ENST00000498009 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
ATXN10-211ENST00000498009 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
ATXN10-211ENST00000498009 SMARCA4P51532 1647 aa40.82■■■■■ 4.12
ATXN10-211ENST00000498009 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.73■■■■■ 4.11
ATXN10-211ENST00000498009 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.7■■■■■ 4.11
ATXN10-211ENST00000498009 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.68■■■■■ 4.1
ATXN10-211ENST00000498009 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
ATXN10-211ENST00000498009 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.45■■■■■ 4.07
ATXN10-211ENST00000498009 SMARCA2P51531 1590 aa40.44■■■■■ 4.06
ATXN10-211ENST00000498009 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.38■■■■■ 4.05
ATXN10-211ENST00000498009 NCAPD3P42695 1498 aa40.32■■■■■ 4.05
ATXN10-211ENST00000498009 WIZO95785 1651 aa40.31■■■■■ 4.04
ATXN10-211ENST00000498009 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
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ATXN10-211ENST00000498009 HMGXB3Q12766 1538 aa40.15■■■■■ 4.02
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ATXN10-211ENST00000498009 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.22■■■■□ 3.87
ATXN10-211ENST00000498009 NESP48681 1621 aa39.14■■■■□ 3.86
ATXN10-211ENST00000498009 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.12■■■■□ 3.85
ATXN10-211ENST00000498009 CFTRP13569 1480 aa39.1■■■■□ 3.85
ATXN10-211ENST00000498009 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.91■■■■□ 3.82
ATXN10-211ENST00000498009 ERCC6Q03468 1493 aa38.78■■■■□ 3.8
ATXN10-211ENST00000498009 PRDM2Q13029 1718 aa38.76■■■■□ 3.8
ATXN10-211ENST00000498009 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.76■■■■□ 3.8
ATXN10-211ENST00000498009 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.64■■■■□ 3.78
ATXN10-211ENST00000498009 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.64■■■■□ 3.78
ATXN10-211ENST00000498009 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.43■■■■□ 3.74
ATXN10-211ENST00000498009 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.32■■■■□ 3.73
ATXN10-211ENST00000498009 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
ATXN10-211ENST00000498009 ABCC8Q09428 1581 aa38.27■■■■□ 3.72
ATXN10-211ENST00000498009 WDR62O43379 1518 aa38.23■■■■□ 3.71
ATXN10-211ENST00000498009 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.22■■■■□ 3.71
ATXN10-211ENST00000498009 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.19■■■■□ 3.7
ATXN10-211ENST00000498009 TOPBP1Q92547 1522 aa38.19■■■■□ 3.7
ATXN10-211ENST00000498009 CUX1P39880 1505 aa38.16■■■■□ 3.7
ATXN10-211ENST00000498009 CUX2O14529 1486 aa38.05■■■■□ 3.68
ATXN10-211ENST00000498009 SYNJ1O43426 1573 aa38.03■■■■□ 3.68
ATXN10-211ENST00000498009 TOP2BQ02880 1626 aa38.01■■■■□ 3.67
ATXN10-211ENST00000498009 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.98■■■■□ 3.67
ATXN10-211ENST00000498009 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.94■■■■□ 3.66
ATXN10-211ENST00000498009 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.92■■■■□ 3.66
ATXN10-211ENST00000498009 TRIM41Q8WV44 630 aa37.92■■■■□ 3.66
ATXN10-211ENST00000498009 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.87■■■■□ 3.65
ATXN10-211ENST00000498009 SOGA1O94964 1423 aa37.84■■■■□ 3.65
ATXN10-211ENST00000498009 IFT140Q96RY7 1462 aa37.8■■■■□ 3.64
ATXN10-211ENST00000498009 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.77■■■■□ 3.64
ATXN10-211ENST00000498009 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.69■■■■□ 3.62
ATXN10-211ENST00000498009 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.59■■■■□ 3.61
ATXN10-211ENST00000498009 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.55■■■■□ 3.6
ATXN10-211ENST00000498009 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
ATXN10-211ENST00000498009 WDR97A6NE52 1622 aa37.5■■■■□ 3.59
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ATXN10-211ENST00000498009 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
ATXN10-211ENST00000498009 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.39■■■■□ 3.58
ATXN10-211ENST00000498009 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.34■■■■□ 3.57
ATXN10-211ENST00000498009 GRIN2BQ13224 1484 aa37.28■■■■□ 3.56
ATXN10-211ENST00000498009 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.24■■■■□ 3.55
ATXN10-211ENST00000498009 PBRM1Q86U86 1689 aa37.18■■■■□ 3.54
ATXN10-211ENST00000498009 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.15■■■■□ 3.54
ATXN10-211ENST00000498009 IGF1RP08069 1367 aa37.15■■■■□ 3.54
ATXN10-211ENST00000498009 EEA1Q15075 1411 aa37.14■■■■□ 3.54
ATXN10-211ENST00000498009 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.13■■■■□ 3.53
ATXN10-211ENST00000498009 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.12■■■■□ 3.53
ATXN10-211ENST00000498009 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
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ATXN10-211ENST00000498009 FBLN2P98095 1184 aa36.98■■■■□ 3.51
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ATXN10-211ENST00000498009 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
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ATXN10-211ENST00000498009 CHD1O14646 1710 aa36.78■■■■□ 3.48
ATXN10-211ENST00000498009 OSCARQ8IYS5 282 aa36.71■■■■□ 3.47
ATXN10-211ENST00000498009 KIF21BO75037 1637 aa36.64■■■■□ 3.46
ATXN10-211ENST00000498009 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.59■■■■□ 3.45
ATXN10-211ENST00000498009 NUP160Q12769 1436 aa36.58■■■■□ 3.45
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ATXN10-211ENST00000498009 CEP170Q5SW79 1584 aa36.53■■■■□ 3.44
ATXN10-211ENST00000498009 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
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