RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485537.1

TTL-204, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

TSL 3

Gene TTL, Length 1,094 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-204ENST00000485537 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.38■■■■■ 6.78
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TTL-204ENST00000485537 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.77■■■■■ 5.56
TTL-204ENST00000485537 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.72■■■■■ 5.55
TTL-204ENST00000485537 NACADO15069 1562 aa49.16■■■■■ 5.46
TTL-204ENST00000485537 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.82■■■■■ 5.41
TTL-204ENST00000485537 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.77■■■■■ 5.4
TTL-204ENST00000485537 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.61■■■■■ 5.37
TTL-204ENST00000485537 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.22■■■■■ 5.31
TTL-204ENST00000485537 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.19■■■■■ 5.31
TTL-204ENST00000485537 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.53■■■■■ 5.2
TTL-204ENST00000485537 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.43■■■■■ 5.18
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TTL-204ENST00000485537 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.4■■■■■ 5.18
TTL-204ENST00000485537 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.32■■■■■ 5.17
TTL-204ENST00000485537 SCRIBQ14160 1630 aa47.27■■■■■ 5.16
TTL-204ENST00000485537 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
TTL-204ENST00000485537 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.25■■■■■ 4.99
TTL-204ENST00000485537 CUX2O14529 1486 aa45.56■■■■■ 4.88
TTL-204ENST00000485537 ERCC6Q03468 1493 aa45.49■■■■■ 4.87
TTL-204ENST00000485537 NCAPD3P42695 1498 aa45.34■■■■■ 4.85
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TTL-204ENST00000485537 SMARCA2P51531 1590 aa45.03■■■■■ 4.8
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TTL-204ENST00000485537 SMARCA4P51532 1647 aa44.97■■■■■ 4.79
TTL-204ENST00000485537 NESP48681 1621 aa44.91■■■■■ 4.78
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TTL-204ENST00000485537 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.47■■■■■ 4.71
TTL-204ENST00000485537 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.38■■■■■ 4.69
TTL-204ENST00000485537 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.27■■■■■ 4.68
TTL-204ENST00000485537 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.21■■■■■ 4.67
TTL-204ENST00000485537 TRIM41Q8WV44 630 aa44.08■■■■■ 4.65
TTL-204ENST00000485537 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.95■■■■■ 4.63
TTL-204ENST00000485537 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.95■■■■■ 4.63
TTL-204ENST00000485537 WDR62O43379 1518 aa43.84■■■■■ 4.61
TTL-204ENST00000485537 WIZO95785 1651 aa43.69■■■■■ 4.58
TTL-204ENST00000485537 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.65■■■■■ 4.58
TTL-204ENST00000485537 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.51■■■■■ 4.56
TTL-204ENST00000485537 OSCARQ8IYS5 282 aa43.33■■■■■ 4.53
TTL-204ENST00000485537 CFTRP13569 1480 aa43.3■■■■■ 4.52
TTL-204ENST00000485537 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
TTL-204ENST00000485537 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.09■■■■■ 4.49
TTL-204ENST00000485537 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.01■■■■■ 4.48
TTL-204ENST00000485537 PRDM2Q13029 1718 aa42.94■■■■■ 4.47
TTL-204ENST00000485537 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.92■■■■■ 4.46
TTL-204ENST00000485537 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.92■■■■■ 4.46
TTL-204ENST00000485537 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.92■■■■■ 4.46
TTL-204ENST00000485537 IFT140Q96RY7 1462 aa42.77■■■■■ 4.44
TTL-204ENST00000485537 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
TTL-204ENST00000485537 ARHGEF11O15085 1522 aa42.69■■■■■ 4.42
TTL-204ENST00000485537 TOPBP1Q92547 1522 aa42.6■■■■■ 4.41
TTL-204ENST00000485537 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.56■■■■■ 4.4
TTL-204ENST00000485537 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
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TTL-204ENST00000485537 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.4■■■■■ 4.38
TTL-204ENST00000485537 CHD1O14646 1710 aa42.4■■■■■ 4.38
TTL-204ENST00000485537 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.28■■■■■ 4.36
TTL-204ENST00000485537 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.36
TTL-204ENST00000485537 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
TTL-204ENST00000485537 FBLN2P98095 1184 aa42.22■■■■■ 4.35
TTL-204ENST00000485537 ARAP1Q96P48 1450 aa42.2■■■■■ 4.35
TTL-204ENST00000485537 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
TTL-204ENST00000485537 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.97■■■■■ 4.31
TTL-204ENST00000485537 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
TTL-204ENST00000485537 SOGA1O94964 1423 aa41.9■■■■■ 4.3
TTL-204ENST00000485537 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.88■■■■■ 4.29
TTL-204ENST00000485537 WDR97A6NE52 1622 aa41.81■■■■■ 4.28
TTL-204ENST00000485537 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.81■■■■■ 4.28
TTL-204ENST00000485537 SYNJ1O43426 1573 aa41.79■■■■■ 4.28
TTL-204ENST00000485537 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.77■■■■■ 4.28
TTL-204ENST00000485537 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
TTL-204ENST00000485537 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
TTL-204ENST00000485537 GRIN2BQ13224 1484 aa41.64■■■■■ 4.26
TTL-204ENST00000485537 CUX1P39880 1505 aa41.59■■■■■ 4.25
TTL-204ENST00000485537 SYNJ2O15056 1496 aa41.59■■■■■ 4.25
TTL-204ENST00000485537 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
TTL-204ENST00000485537 PBRM1Q86U86 1689 aa41.5■■■■■ 4.23
TTL-204ENST00000485537 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.43■■■■■ 4.22
TTL-204ENST00000485537 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.26■■■■■ 4.2
TTL-204ENST00000485537 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.22■■■■■ 4.19
TTL-204ENST00000485537 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.12■■■■■ 4.17
TTL-204ENST00000485537 GRIN2AQ12879 1464 aa41.11■■■■■ 4.17
TTL-204ENST00000485537 ADAMTS12P58397 1594 aa41.03■■■■■ 4.16
TTL-204ENST00000485537 CEP170Q5SW79 1584 aa41.01■■■■■ 4.16
TTL-204ENST00000485537 NUP160Q12769 1436 aa40.94■■■■■ 4.14
TTL-204ENST00000485537 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.94■■■■■ 4.14
TTL-204ENST00000485537 SHROOM2Q13796 1616 aa40.88■■■■■ 4.13
TTL-204ENST00000485537 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.84■■■■■ 4.13
TTL-204ENST00000485537 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.78■■■■■ 4.12
TTL-204ENST00000485537 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.77■■■■■ 4.12
TTL-204ENST00000485537 TOP2BQ02880 1626 aa40.75■■■■■ 4.11
TTL-204ENST00000485537 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.71■■■■■ 4.11
TTL-204ENST00000485537 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
TTL-204ENST00000485537 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
TTL-204ENST00000485537 JPH4Q96JJ6 628 aa40.52■■■■■ 4.08
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