RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-211ENST00000559850 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.34■■■■□ 3.41
RABGGTA-211ENST00000559850 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.39■■■□□ 2.78
RABGGTA-211ENST00000559850 ABCC9O60706 1549 aa31.87■■■□□ 2.69
RABGGTA-211ENST00000559850 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.52■■■□□ 2.48
RABGGTA-211ENST00000559850 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.49■■■□□ 2.47
RABGGTA-211ENST00000559850 NACADO15069 1562 aa30.42■■■□□ 2.46
RABGGTA-211ENST00000559850 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
RABGGTA-211ENST00000559850 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.11■■■□□ 2.41
RABGGTA-211ENST00000559850 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30■■■□□ 2.39
RABGGTA-211ENST00000559850 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.97■■■□□ 2.39
RABGGTA-211ENST00000559850 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.76■■■□□ 2.359e-10■■□□□ 11.4
RABGGTA-211ENST00000559850 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.67■■■□□ 2.34
RABGGTA-211ENST00000559850 SCRIBQ14160 1630 aa29.63■■■□□ 2.33
RABGGTA-211ENST00000559850 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.37■■■□□ 2.29
RABGGTA-211ENST00000559850 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.15■■■□□ 2.26
RABGGTA-211ENST00000559850 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
RABGGTA-211ENST00000559850 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.82■■■□□ 2.2
RABGGTA-211ENST00000559850 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.59■■■□□ 2.17
RABGGTA-211ENST00000559850 SMARCA4P51532 1647 aa28.28■■■□□ 2.12
RABGGTA-211ENST00000559850 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
RABGGTA-211ENST00000559850 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.09■■■□□ 2.09
RABGGTA-211ENST00000559850 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.07■■■□□ 2.08
RABGGTA-211ENST00000559850 NCAPD3P42695 1498 aa28.05■■■□□ 2.08
RABGGTA-211ENST00000559850 SMARCA2P51531 1590 aa28.03■■■□□ 2.08
RABGGTA-211ENST00000559850 HMGXB3Q12766 1538 aa27.92■■■□□ 2.06
RABGGTA-211ENST00000559850 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.91■■■□□ 2.06
RABGGTA-211ENST00000559850 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
RABGGTA-211ENST00000559850 WIZO95785 1651 aa27.82■■■□□ 2.04
RABGGTA-211ENST00000559850 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
RABGGTA-211ENST00000559850 NESP48681 1621 aa27.57■■■□□ 2
RABGGTA-211ENST00000559850 ERCC6Q03468 1493 aa27.43■■□□□ 1.98
RABGGTA-211ENST00000559850 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
RABGGTA-211ENST00000559850 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.37■■□□□ 1.97
RABGGTA-211ENST00000559850 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.28■■□□□ 1.96
RABGGTA-211ENST00000559850 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.23■■□□□ 1.95
RABGGTA-211ENST00000559850 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
RABGGTA-211ENST00000559850 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.15■■□□□ 1.94
RABGGTA-211ENST00000559850 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.11■■□□□ 1.93
RABGGTA-211ENST00000559850 CUX2O14529 1486 aa27.11■■□□□ 1.93
RABGGTA-211ENST00000559850 CFTRP13569 1480 aa27.06■■□□□ 1.92
RABGGTA-211ENST00000559850 PRDM2Q13029 1718 aa26.98■■□□□ 1.91
RABGGTA-211ENST00000559850 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.97■■□□□ 1.91
RABGGTA-211ENST00000559850 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.95■■□□□ 1.91
RABGGTA-211ENST00000559850 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.93■■□□□ 1.9
RABGGTA-211ENST00000559850 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
RABGGTA-211ENST00000559850 WDR62O43379 1518 aa26.86■■□□□ 1.89
RABGGTA-211ENST00000559850 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
RABGGTA-211ENST00000559850 TOPBP1Q92547 1522 aa26.55■■□□□ 1.84
RABGGTA-211ENST00000559850 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.5■■□□□ 1.83
RABGGTA-211ENST00000559850 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.44■■□□□ 1.82
RABGGTA-211ENST00000559850 ABCC8Q09428 1581 aa26.43■■□□□ 1.82
RABGGTA-211ENST00000559850 IFT140Q96RY7 1462 aa26.36■■□□□ 1.81
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
RABGGTA-211ENST00000559850 CUX1P39880 1505 aa26.33■■□□□ 1.81
RABGGTA-211ENST00000559850 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
RABGGTA-211ENST00000559850 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
RABGGTA-211ENST00000559850 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
RABGGTA-211ENST00000559850 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.25■■□□□ 1.79
RABGGTA-211ENST00000559850 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.24■■□□□ 1.79
RABGGTA-211ENST00000559850 SOGA1O94964 1423 aa26.18■■□□□ 1.78
RABGGTA-211ENST00000559850 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.17■■□□□ 1.78
RABGGTA-211ENST00000559850 SYNJ1O43426 1573 aa26.1■■□□□ 1.77
RABGGTA-211ENST00000559850 WDR97A6NE52 1622 aa26.09■■□□□ 1.77
RABGGTA-211ENST00000559850 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
RABGGTA-211ENST00000559850 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.07■■□□□ 1.76
RABGGTA-211ENST00000559850 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
RABGGTA-211ENST00000559850 TOP2BQ02880 1626 aa26.04■■□□□ 1.76
RABGGTA-211ENST00000559850 CHD1O14646 1710 aa26■■□□□ 1.75
RABGGTA-211ENST00000559850 OSCARQ8IYS5 282 aa25.97■■□□□ 1.75
RABGGTA-211ENST00000559850 PBRM1Q86U86 1689 aa25.95■■□□□ 1.74
RABGGTA-211ENST00000559850 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.93■■□□□ 1.74
RABGGTA-211ENST00000559850 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.91■■□□□ 1.74
RABGGTA-211ENST00000559850 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.91■■□□□ 1.74
RABGGTA-211ENST00000559850 GRIN2BQ13224 1484 aa25.87■■□□□ 1.73
RABGGTA-211ENST00000559850 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.87■■□□□ 1.73
RABGGTA-211ENST00000559850 FBLN2P98095 1184 aa25.87■■□□□ 1.73
RABGGTA-211ENST00000559850 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
RABGGTA-211ENST00000559850 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
RABGGTA-211ENST00000559850 SYNJ2O15056 1496 aa25.72■■□□□ 1.71
RABGGTA-211ENST00000559850 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.7■■□□□ 1.71
RABGGTA-211ENST00000559850 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.7■■□□□ 1.71
RABGGTA-211ENST00000559850 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.7■■□□□ 1.71
RABGGTA-211ENST00000559850 ADAMTS12P58397 1594 aa25.67■■□□□ 1.7
RABGGTA-211ENST00000559850 TRIM41Q8WV44 630 aa25.64■■□□□ 1.7
RABGGTA-211ENST00000559850 ARHGEF11O15085 1522 aa25.63■■□□□ 1.69
RABGGTA-211ENST00000559850 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.62■■□□□ 1.69
RABGGTA-211ENST00000559850 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.61■■□□□ 1.69
RABGGTA-211ENST00000559850 GRIN2AQ12879 1464 aa25.57■■□□□ 1.68
RABGGTA-211ENST00000559850 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.54■■□□□ 1.68
RABGGTA-211ENST00000559850 CEP170Q5SW79 1584 aa25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-211ENST00000559850 KIF27Q86VH2 1401 aa25.5■■□□□ 1.67
RABGGTA-211ENST00000559850 ARAP1Q96P48 1450 aa25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-211ENST00000559850 NUP160Q12769 1436 aa25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-211ENST00000559850 IGF1RP08069 1367 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-211ENST00000559850 CUL7Q14999 1698 aa25.4■■□□□ 1.66
RABGGTA-211ENST00000559850 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.39■■□□□ 1.66
RABGGTA-211ENST00000559850 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.37■■□□□ 1.65
RABGGTA-211ENST00000559850 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.35■■□□□ 1.65
RABGGTA-211ENST00000559850 SHROOM2Q13796 1616 aa25.31■■□□□ 1.64
RABGGTA-211ENST00000559850 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms