Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH4O75427 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms