Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-219ENST00000599329 582 ntTSL 316.7■□□□□ 0.267e-9■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF2-217ENST00000497907 764 ntTSL 320.5■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.021e-6■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 37
UTP3Q9NQZ2 MSH5-212ENST00000467319 688 ntTSL 211.79□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 37
UTP3Q9NQZ2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 37
UTP3Q9NQZ2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.941e-6■■■■■ 37
UTP3Q9NQZ2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 37
UTP3Q9NQZ2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 37
UTP3Q9NQZ2 KXD1-214ENST00000600654 895 ntTSL 512.36□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 37
UTP3Q9NQZ2 KXD1-216ENST00000601630 1327 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 37
UTP3Q9NQZ2 PTDSS2-206ENST00000527325 723 ntTSL 321.54■■□□□ 1.045e-8■■■■■ 37
UTP3Q9NQZ2 TPM4-208ENST00000588410 563 ntTSL 420.81■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 TPM4-204ENST00000586499 708 ntTSL 420.36■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 TPM4-206ENST00000587201 877 ntTSL 218.84■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.51e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.345e-7■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 REPIN1-213ENST00000488943 1262 ntTSL 521.51■■□□□ 1.035e-7■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.173e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-213ENST00000523744 5740 nt9.39□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-262ENST00000637857 2585 ntTSL 55.94□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-208ENST00000519545 771 ntTSL 35.76□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.682e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 NELFCD-208ENST00000482747 1701 ntTSL 218.27■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 BMI1-209ENST00000602523 748 ntTSL 1 (best)23.28■■□□□ 1.323e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.234e-7■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 TWSG1-203ENST00000583147 2311 ntTSL 222.37■■□□□ 1.171e-10■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 PTGES2-211ENST00000493205 1514 ntTSL 521.1■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 COMMD3-BMI1-201ENST00000417470 745 ntTSL 518.68■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.513e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.441e-10■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 PTGES2-205ENST00000476655 1063 ntTSL 317.06■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 COMMD3-BMI1-204ENST00000489125 329 ntTSL 217■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.144e-7■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 LIG3-205ENST00000585941 1699 ntTSL 1 (best)15.23■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.021e-10■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 TANGO2-221ENST00000476940 414 ntTSL 513.66□□□□□ -0.226e-11■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 LIG3-213ENST00000590630 904 ntTSL 512.68□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 EIF4G1-228ENST00000456033 694 ntTSL 512.33□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 COMMD3-BMI1-206ENST00000602395 621 ntTSL 210.59□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 COMMD3-BMI1-205ENST00000602390 1419 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 COMMD3-BMI1-203ENST00000475460 508 ntTSL 28.61□□□□□ -1.033e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 COMMD3-BMI1-202ENST00000463409 605 ntTSL 37.12□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 DHX15-204ENST00000508032 3028 ntTSL 1 (best)4.19□□□□□ -1.741e-7■■■■■ 36.9
UTP3Q9NQZ2 AARS-207ENST00000569825 871 ntTSL 218.33■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 36.8
UTP3Q9NQZ2 SMG7-205ENST00000440812 1190 ntTSL 522.22■■□□□ 1.154e-6■■■■■ 36.8
UTP3Q9NQZ2 SMG7-211ENST00000507406 582 ntTSL 36.02□□□□□ -1.454e-6■■■■■ 36.8
UTP3Q9NQZ2 RACK1-205ENST00000502905 643 ntTSL 310.68□□□□□ -0.78e-11■■■■■ 36.8
UTP3Q9NQZ2 RACK1-217ENST00000507756 889 ntTSL 59.17□□□□□ -0.948e-11■■■■■ 36.8
UTP3Q9NQZ2 NAP1L4-218ENST00000530064 625 ntTSL 58.26□□□□□ -1.091e-7■■■■■ 36.8
UTP3Q9NQZ2 NAP1L4-205ENST00000455338 352 ntTSL 54.42□□□□□ -1.71e-7■■■■■ 36.8
UTP3Q9NQZ2 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.145e-7■■■■■ 36.8
UTP3Q9NQZ2 DNM2-222ENST00000593220 561 ntTSL 315.04■□□□□ -06e-15■■■■■ 36.8
UTP3Q9NQZ2 TCF25-222ENST00000568412 797 ntTSL 317.61■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 36.8
UTP3Q9NQZ2 RNPEP-212ENST00000492587 780 ntTSL 523.34■■□□□ 1.339e-7■■■■■ 36.8
UTP3Q9NQZ2 DCAF15-202ENST00000585468 815 ntTSL 218.29■□□□□ 0.529e-7■■■■■ 36.8
UTP3Q9NQZ2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 36.7
UTP3Q9NQZ2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 36.7
UTP3Q9NQZ2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 36.7
UTP3Q9NQZ2 STXBP2-211ENST00000597068 1785 ntTSL 1 (best)16.19■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 36.7
UTP3Q9NQZ2 GOLGA2-205ENST00000462089 766 ntTSL 312.47□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 36.7
UTP3Q9NQZ2 DKC1-212ENST00000492372 406 ntTSL 29.35□□□□□ -0.914e-9■■■■■ 36.6
UTP3Q9NQZ2 SELENOI-203ENST00000447170 624 ntTSL 512.61□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 36.6
UTP3Q9NQZ2 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 36.6
UTP3Q9NQZ2 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.581e-6■■■■■ 36.6
UTP3Q9NQZ2 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 36.6
UTP3Q9NQZ2 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 36.6
UTP3Q9NQZ2 PICALM-223ENST00000534412 811 ntTSL 59.23□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 36.6
UTP3Q9NQZ2 HIST1H2BN-201ENST00000396980 432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 36.6
UTP3Q9NQZ2 ACTB-212ENST00000484841 1032 ntTSL 521.32■■□□□ 17e-9■■■■■ 36.6
UTP3Q9NQZ2 ACTB-209ENST00000473257 556 ntTSL 311.94□□□□□ -0.57e-9■■■■■ 36.6
UTP3Q9NQZ2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.742e-10■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.929e-9■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 PLXNA3-206ENST00000491066 604 ntTSL 219.66■□□□□ 0.749e-9■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.679e-9■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 RNH1-219ENST00000531223 572 ntTSL 316.21■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 MRPL4-208ENST00000590702 876 ntTSL 515.26■□□□□ 0.039e-9■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 PLXNA3-204ENST00000480645 160 ntTSL 310.9□□□□□ -0.669e-9■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 KRIT1-202ENST00000394503 2827 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 KRIT1-204ENST00000394507 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 KRIT1-203ENST00000394505 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 LUC7L2-205ENST00000463912 2382 ntTSL 27.09□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.884e-6■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 AKAP8L-203ENST00000594594 2251 ntTSL 524.3■■□□□ 1.484e-6■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.984e-6■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 AKAP8L-220ENST00000609519 2113 ntTSL 221.17■□□□□ 0.984e-6■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 AKAP8L-202ENST00000593845 2749 ntTSL 219.71■□□□□ 0.754e-6■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 LUC7L-213ENST00000464711 2134 ntTSL 216.58■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 TCF25-204ENST00000561958 763 ntTSL 317.61■□□□□ 0.413e-7■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 PUM2-211ENST00000446940 525 ntTSL 415.67■□□□□ 0.17e-7■■■■■ 36.5
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