Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 TUBB-207ENST00000396384 2823 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.811e-8■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 COPZ1-216ENST00000552848 537 ntTSL 59.32□□□□□ -0.922e-12■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 RACK1-233ENST00000514455 791 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.982e-12■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 RACK1-222ENST00000509535 456 ntTSL 37.8□□□□□ -1.162e-12■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 COPZ1-210ENST00000550713 548 ntTSL 27.47□□□□□ -1.212e-12■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 COPZ1-203ENST00000548076 367 ntTSL 57.3□□□□□ -1.242e-12■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 CLK1-209ENST00000472679 461 ntTSL 25.65□□□□□ -1.51e-8■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.751e-8■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 CLK1-208ENST00000464454 484 ntTSL 24.07□□□□□ -1.761e-8■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 CLK1-206ENST00000461326 435 ntTSL 23.61□□□□□ -1.831e-8■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 CLK1-214ENST00000496205 480 ntTSL 23.57□□□□□ -1.841e-8■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.861e-8■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 MED15-226ENST00000478831 707 ntTSL 410.41□□□□□ -0.741e-8■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 PPP4R1-210ENST00000578557 571 ntTSL 47.97□□□□□ -1.133e-8■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 PPP4R1-227ENST00000583988 582 ntTSL 33.9□□□□□ -1.793e-8■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 PSMD14-202ENST00000437630 577 ntTSL 59.66□□□□□ -0.862e-13■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 DOT1L-208ENST00000591498 567 ntTSL 412.66□□□□□ -0.384e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 SPNS1-209ENST00000567771 829 ntTSL 323.19■■□□□ 1.34e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 KEAP1-206ENST00000590593 582 ntTSL 318.83■□□□□ 0.64e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.534e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 DNPEP-202ENST00000322176 925 ntTSL 318.3■□□□□ 0.524e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 SPNS1-212ENST00000568900 2253 ntTSL 218.07■□□□□ 0.484e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 KAT2A-203ENST00000586972 852 ntTSL 217.36■□□□□ 0.374e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 PKD1-223ENST00000561668 665 ntTSL 317.07■□□□□ 0.324e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 SPNS1-210ENST00000568388 759 ntTSL 316.73■□□□□ 0.274e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 PKD1-227ENST00000564313 568 ntTSL 416.61■□□□□ 0.254e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 GAA-205ENST00000572080 723 ntTSL 315.19■□□□□ 0.024e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 GAA-203ENST00000570716 534 ntTSL 214.79□□□□□ -0.044e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 GAA-206ENST00000572803 575 ntTSL 214.79□□□□□ -0.044e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 KEAP1-210ENST00000592478 1044 ntTSL 1 (best)14.5□□□□□ -0.094e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.194e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 GPS2-214ENST00000574201 550 ntTSL 213.82□□□□□ -0.24e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 DNPEP-207ENST00000430206 577 ntTSL 312.69□□□□□ -0.384e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 DNPEP-208ENST00000434339 638 ntTSL 312.69□□□□□ -0.384e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 DNPEP-217ENST00000520694 673 ntTSL 312.22□□□□□ -0.454e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 DNPEP-210ENST00000460963 1610 ntTSL 211.79□□□□□ -0.524e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RETSAT-204ENST00000438611 1500 ntTSL 510.06□□□□□ -0.84e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 WDR1-217ENST00000515018 274 ntTSL 36.99□□□□□ -1.294e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 PRAF2-203ENST00000618882 439 ntTSL 56.97□□□□□ -1.294e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 WDR1-201ENST00000264785 549 ntTSL 46.55□□□□□ -1.364e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 KEAP1-205ENST00000590237 451 ntTSL 25.22□□□□□ -1.574e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 DCTN2-208ENST00000547480 599 ntTSL 214.22□□□□□ -0.131e-9■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 DCTN2-221ENST00000551400 568 ntTSL 311.66□□□□□ -0.541e-9■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 DCTN2-207ENST00000547345 566 ntTSL 26.33□□□□□ -1.41e-9■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 DCTN2-216ENST00000550576 397 ntTSL 34.64□□□□□ -1.671e-9■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.51□□□□□ -2.012e-18■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 NDUFS2-208ENST00000478866 1076 ntTSL 217.8■□□□□ 0.444e-8■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RNF168-202ENST00000437070 2202 ntTSL 217.53■□□□□ 0.42e-10■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 EDC4-213ENST00000577028 747 ntTSL 415.85■□□□□ 0.134e-8■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.052e-10■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 PAPOLA-218ENST00000556248 652 ntTSL 514□□□□□ -0.177e-13■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 UNC13D-214ENST00000590856 695 ntTSL 311.88□□□□□ -0.514e-8■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 NEMF-206ENST00000555411 573 ntTSL 46.58□□□□□ -1.364e-8■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 ANAPC5-215ENST00000539612 654 ntTSL 35.3□□□□□ -1.564e-8■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 ANAPC5-212ENST00000538223 292 ntTSL 55.02□□□□□ -1.614e-8■□□□□ 8.8
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SF3B4Q15427 GPBP1L1-205ENST00000468724 559 ntTSL 34.41□□□□□ -1.72e-10■□□□□ 8.8
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SF3B4Q15427 SNX14-218ENST00000514801 359 ntTSL 24.26□□□□□ -1.732e-10■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 PAPOLA-210ENST00000554887 547 ntTSL 43.29□□□□□ -1.887e-13■□□□□ 8.8
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SF3B4Q15427 SNX14-207ENST00000503491 3491 ntTSL 22.65□□□□□ -1.982e-10■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 ERBB2-209ENST00000578709 559 ntTSL 421.41■■□□□ 1.024e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.24e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RAD52-215ENST00000542785 633 ntTSL 416.22■□□□□ 0.194e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 ERBB2-222ENST00000584908 1316 ntTSL 1 (best)14.73□□□□□ -0.054e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 ATP6V0A1-207ENST00000585828 2139 ntTSL 1 (best)14.62□□□□□ -0.075e-7■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RAD52-205ENST00000461568 1531 ntTSL 1 (best)14.36□□□□□ -0.114e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.144e-8■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 FOSL2-203ENST00000436647 889 ntTSL 213.69□□□□□ -0.224e-8■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RAD52-208ENST00000481052 2464 ntTSL 212.54□□□□□ -0.44e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RAD52-216ENST00000543912 1243 ntTSL 1 (best)12.3□□□□□ -0.444e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RAD52-206ENST00000463750 1510 ntTSL 212.1□□□□□ -0.474e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RAD52-209ENST00000488642 2413 ntTSL 211.98□□□□□ -0.494e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 ERBB2-217ENST00000584099 583 ntTSL 411.94□□□□□ -0.54e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RAD52-207ENST00000468231 2499 ntTSL 211.87□□□□□ -0.514e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RPS19-204ENST00000598399 1172 ntTSL 511.76□□□□□ -0.534e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RAD52-204ENST00000430095 2366 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.544e-6■□□□□ 8.8
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SF3B4Q15427 PSMD3-203ENST00000485835 2888 ntTSL 211.14□□□□□ -0.634e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RAD52-212ENST00000541619 560 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.654e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RPS19-203ENST00000598261 307 ntTSL 311□□□□□ -0.654e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 FOSL2-202ENST00000379619 5829 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.674e-8■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RAD52-214ENST00000542584 541 ntTSL 410.85□□□□□ -0.674e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 ATP6V0A1-219ENST00000588806 842 ntTSL 210.8□□□□□ -0.685e-7■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 ATP6V0A1-217ENST00000588138 573 ntTSL 510.56□□□□□ -0.725e-7■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RAD52-202ENST00000358495 2710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.784e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RAD52-201ENST00000228345 2826 ntTSL 210.02□□□□□ -0.84e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RAD52-217ENST00000544742 463 ntTSL 4 BASIC8.82□□□□□ -14e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RAD52-219ENST00000545967 577 ntTSL 48.54□□□□□ -1.044e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RAD52-218ENST00000545564 681 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.054e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 RAD52-203ENST00000397230 530 ntTSL 57.58□□□□□ -1.24e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 ATP6V0A1-213ENST00000587510 564 ntTSL 46.48□□□□□ -1.375e-7■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 SLC3A2-221ENST00000544377 589 ntTSL 415.13■□□□□ 0.015e-14■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 SLC3A2-216ENST00000541372 269 ntTSL 513.95□□□□□ -0.185e-14■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 WEE1-205ENST00000527848 465 ntTSL 26.2□□□□□ -1.422e-6■□□□□ 8.8
SF3B4Q15427 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.018e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.188e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 YES1-204ENST00000581960 487 ntTSL 321.95■■□□□ 1.18e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 FKBP4-204ENST00000540260 777 ntTSL 321.43■■□□□ 1.028e-6■□□□□ 8.7
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