RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568900.5

SPNS1-212, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2

Gene SPNS1, Length 2,253 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-212ENST00000568900 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.87■■■■■ 5.09
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.75■■■■■ 4.11
SPNS1-212ENST00000568900 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
SPNS1-212ENST00000568900 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.82■■■■□ 3.8
SPNS1-212ENST00000568900 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.67■■■■□ 3.78
SPNS1-212ENST00000568900 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.53■■■■□ 3.76
SPNS1-212ENST00000568900 ABCC9O60706 1549 aa38.51■■■■□ 3.75
SPNS1-212ENST00000568900 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.12■■■■□ 3.69
SPNS1-212ENST00000568900 NACADO15069 1562 aa37.91■■■■□ 3.66
SPNS1-212ENST00000568900 SCRIBQ14160 1630 aa37.63■■■■□ 3.61
SPNS1-212ENST00000568900 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.57■■■■□ 3.6
SPNS1-212ENST00000568900 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
SPNS1-212ENST00000568900 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.91■■■■□ 3.5
SPNS1-212ENST00000568900 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.47■■■■□ 3.43
SPNS1-212ENST00000568900 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.47■■■■□ 3.43
SPNS1-212ENST00000568900 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.42
SPNS1-212ENST00000568900 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.38■■■■□ 3.41
SPNS1-212ENST00000568900 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.26■■■■□ 3.4
SPNS1-212ENST00000568900 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
SPNS1-212ENST00000568900 WIZO95785 1651 aa36.01■■■■□ 3.36
SPNS1-212ENST00000568900 SMARCA4P51532 1647 aa36.01■■■■□ 3.36
SPNS1-212ENST00000568900 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.57■■■■□ 3.28
SPNS1-212ENST00000568900 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
SPNS1-212ENST00000568900 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.5■■■■□ 3.27
SPNS1-212ENST00000568900 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.36■■■■□ 3.25
SPNS1-212ENST00000568900 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
SPNS1-212ENST00000568900 SMARCA2P51531 1590 aa35.33■■■■□ 3.25
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.24■■■■□ 3.23
SPNS1-212ENST00000568900 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.22
SPNS1-212ENST00000568900 NCAPD3P42695 1498 aa34.99■■■■□ 3.19
SPNS1-212ENST00000568900 HMGXB3Q12766 1538 aa34.96■■■■□ 3.19
SPNS1-212ENST00000568900 TRIM41Q8WV44 630 aa34.85■■■■□ 3.17
SPNS1-212ENST00000568900 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.81■■■■□ 3.16
SPNS1-212ENST00000568900 ABCC8Q09428 1581 aa34.62■■■■□ 3.13
SPNS1-212ENST00000568900 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
SPNS1-212ENST00000568900 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.31■■■■□ 3.08
SPNS1-212ENST00000568900 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.3■■■■□ 3.08
SPNS1-212ENST00000568900 CFTRP13569 1480 aa34.28■■■■□ 3.08
SPNS1-212ENST00000568900 SYNJ1O43426 1573 aa34.19■■■■□ 3.06
SPNS1-212ENST00000568900 PRDM2Q13029 1718 aa34.15■■■■□ 3.06
SPNS1-212ENST00000568900 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.14■■■■□ 3.06
SPNS1-212ENST00000568900 TOP2BQ02880 1626 aa34■■■■□ 3.03
SPNS1-212ENST00000568900 SOGA1O94964 1423 aa33.99■■■■□ 3.03
SPNS1-212ENST00000568900 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.96■■■■□ 3.03
SPNS1-212ENST00000568900 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.96■■■■□ 3.03
SPNS1-212ENST00000568900 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.9■■■■□ 3.02
SPNS1-212ENST00000568900 CUX1P39880 1505 aa33.89■■■■□ 3.02
SPNS1-212ENST00000568900 NESP48681 1621 aa33.87■■■■□ 3.01
SPNS1-212ENST00000568900 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.87■■■■□ 3.01
SPNS1-212ENST00000568900 EEA1Q15075 1411 aa33.85■■■■□ 3.01
SPNS1-212ENST00000568900 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.79■■■■□ 3
SPNS1-212ENST00000568900 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.79■■■■□ 3
SPNS1-212ENST00000568900 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.72■■■□□ 2.99
SPNS1-212ENST00000568900 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.56■■■□□ 2.96
SPNS1-212ENST00000568900 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.53■■■□□ 2.96
SPNS1-212ENST00000568900 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.5■■■□□ 2.95
SPNS1-212ENST00000568900 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.49■■■□□ 2.95
SPNS1-212ENST00000568900 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.45■■■□□ 2.95
SPNS1-212ENST00000568900 GOLGA3Q08378 1498 aa33.45■■■□□ 2.95
SPNS1-212ENST00000568900 TOPBP1Q92547 1522 aa33.45■■■□□ 2.94
SPNS1-212ENST00000568900 KIF21BO75037 1637 aa33.44■■■□□ 2.94
SPNS1-212ENST00000568900 KIF27Q86VH2 1401 aa33.41■■■□□ 2.94
SPNS1-212ENST00000568900 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
SPNS1-212ENST00000568900 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
SPNS1-212ENST00000568900 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.36■■■□□ 2.93
SPNS1-212ENST00000568900 CUX2O14529 1486 aa33.33■■■□□ 2.93
SPNS1-212ENST00000568900 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.3■■■□□ 2.92
SPNS1-212ENST00000568900 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.28■■■□□ 2.92
SPNS1-212ENST00000568900 CEP162Q5TB80 1403 aa33.25■■■□□ 2.91
SPNS1-212ENST00000568900 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.24■■■□□ 2.91
SPNS1-212ENST00000568900 PRXQ9BXM0 1461 aa33.22■■■□□ 2.91
SPNS1-212ENST00000568900 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.17■■■□□ 2.9
SPNS1-212ENST00000568900 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.16■■■□□ 2.9
SPNS1-212ENST00000568900 IGF1RP08069 1367 aa33.1■■■□□ 2.89
SPNS1-212ENST00000568900 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.1■■■□□ 2.89
SPNS1-212ENST00000568900 WDR97A6NE52 1622 aa33.06■■■□□ 2.88
SPNS1-212ENST00000568900 ERCC6Q03468 1493 aa32.98■■■□□ 2.87
SPNS1-212ENST00000568900 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.95■■■□□ 2.87
SPNS1-212ENST00000568900 CLIP1P30622 1438 aa32.94■■■□□ 2.86
SPNS1-212ENST00000568900 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
SPNS1-212ENST00000568900 WDR62O43379 1518 aa32.91■■■□□ 2.86
SPNS1-212ENST00000568900 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.91■■■□□ 2.86
SPNS1-212ENST00000568900 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.9■■■□□ 2.86
SPNS1-212ENST00000568900 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.9■■■□□ 2.86
SPNS1-212ENST00000568900 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
SPNS1-212ENST00000568900 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.83■■■□□ 2.85
SPNS1-212ENST00000568900 CUL7Q14999 1698 aa32.82■■■□□ 2.84
SPNS1-212ENST00000568900 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
SPNS1-212ENST00000568900 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
SPNS1-212ENST00000568900 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
SPNS1-212ENST00000568900 IFT140Q96RY7 1462 aa32.71■■■□□ 2.83
SPNS1-212ENST00000568900 PBRM1Q86U86 1689 aa32.66■■■□□ 2.82
SPNS1-212ENST00000568900 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.66■■■□□ 2.82
SPNS1-212ENST00000568900 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.65■■■□□ 2.82
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
SPNS1-212ENST00000568900 ARAP1Q96P48 1450 aa32.6■■■□□ 2.81
SPNS1-212ENST00000568900 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.55■■■□□ 2.8
SPNS1-212ENST00000568900 GRIN2BQ13224 1484 aa32.53■■■□□ 2.8
SPNS1-212ENST00000568900 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.52■■■□□ 2.8
SPNS1-212ENST00000568900 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
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