RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.02■■■■■ 4.64
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.81■■■■□ 3.8
SPNS1-210ENST00000568388 ABCC9O60706 1549 aa37.87■■■■□ 3.65
SPNS1-210ENST00000568388 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.49
SPNS1-210ENST00000568388 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.51■■■■□ 3.44
SPNS1-210ENST00000568388 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.37■■■■□ 3.41
SPNS1-210ENST00000568388 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.35■■■■□ 3.41
SPNS1-210ENST00000568388 NACADO15069 1562 aa36.29■■■■□ 3.4
SPNS1-210ENST00000568388 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.23■■■■□ 3.39
SPNS1-210ENST00000568388 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.53■■■■□ 3.28
SPNS1-210ENST00000568388 SCRIBQ14160 1630 aa35.39■■■■□ 3.26
SPNS1-210ENST00000568388 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.25■■■■□ 3.23
SPNS1-210ENST00000568388 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.21■■■■□ 3.23
SPNS1-210ENST00000568388 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.19■■■■□ 3.22
SPNS1-210ENST00000568388 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.15■■■■□ 3.22
SPNS1-210ENST00000568388 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
SPNS1-210ENST00000568388 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.27■■■■□ 3.08
SPNS1-210ENST00000568388 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.17■■■■□ 3.06
SPNS1-210ENST00000568388 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
SPNS1-210ENST00000568388 SMARCA4P51532 1647 aa33.98■■■■□ 3.03
SPNS1-210ENST00000568388 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.91■■■■□ 3.02
SPNS1-210ENST00000568388 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.83■■■■□ 3.01
SPNS1-210ENST00000568388 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.68■■■□□ 2.98
SPNS1-210ENST00000568388 WIZO95785 1651 aa33.61■■■□□ 2.97
SPNS1-210ENST00000568388 SMARCA2P51531 1590 aa33.6■■■□□ 2.97
SPNS1-210ENST00000568388 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.58■■■□□ 2.97
SPNS1-210ENST00000568388 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.51■■■□□ 2.95
SPNS1-210ENST00000568388 NCAPD3P42695 1498 aa33.47■■■□□ 2.95
SPNS1-210ENST00000568388 HMGXB3Q12766 1538 aa33.37■■■□□ 2.93
SPNS1-210ENST00000568388 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
SPNS1-210ENST00000568388 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.9■■■□□ 2.86
SPNS1-210ENST00000568388 NESP48681 1621 aa32.66■■■□□ 2.82
SPNS1-210ENST00000568388 ERCC6Q03468 1493 aa32.65■■■□□ 2.82
SPNS1-210ENST00000568388 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.52■■■□□ 2.8
SPNS1-210ENST00000568388 CUX2O14529 1486 aa32.5■■■□□ 2.79
SPNS1-210ENST00000568388 CFTRP13569 1480 aa32.5■■■□□ 2.79
SPNS1-210ENST00000568388 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.49■■■□□ 2.79
SPNS1-210ENST00000568388 PRDM2Q13029 1718 aa32.39■■■□□ 2.78
SPNS1-210ENST00000568388 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
SPNS1-210ENST00000568388 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.31■■■□□ 2.76
SPNS1-210ENST00000568388 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.22■■■□□ 2.75
SPNS1-210ENST00000568388 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.12■■■□□ 2.73
SPNS1-210ENST00000568388 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.03■■■□□ 2.72
SPNS1-210ENST00000568388 CEP164Q9UPV0 1460 aa32■■■□□ 2.71
SPNS1-210ENST00000568388 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.97■■■□□ 2.71
SPNS1-210ENST00000568388 WDR62O43379 1518 aa31.92■■■□□ 2.7
SPNS1-210ENST00000568388 ABCC8Q09428 1581 aa31.9■■■□□ 2.7
SPNS1-210ENST00000568388 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.86■■■□□ 2.69
SPNS1-210ENST00000568388 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.82■■■□□ 2.68
SPNS1-210ENST00000568388 CUX1P39880 1505 aa31.76■■■□□ 2.68
SPNS1-210ENST00000568388 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.76■■■□□ 2.67
SPNS1-210ENST00000568388 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
SPNS1-210ENST00000568388 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.75■■■□□ 2.67
SPNS1-210ENST00000568388 SYNJ1O43426 1573 aa31.74■■■□□ 2.67
SPNS1-210ENST00000568388 TOP2BQ02880 1626 aa31.74■■■□□ 2.67
SPNS1-210ENST00000568388 TOPBP1Q92547 1522 aa31.71■■■□□ 2.67
SPNS1-210ENST00000568388 TRIM41Q8WV44 630 aa31.65■■■□□ 2.66
SPNS1-210ENST00000568388 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.52■■■□□ 2.64
SPNS1-210ENST00000568388 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
SPNS1-210ENST00000568388 SOGA1O94964 1423 aa31.38■■■□□ 2.61
SPNS1-210ENST00000568388 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
SPNS1-210ENST00000568388 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.33■■■□□ 2.61
SPNS1-210ENST00000568388 IFT140Q96RY7 1462 aa31.32■■■□□ 2.6
SPNS1-210ENST00000568388 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.29■■■□□ 2.6
SPNS1-210ENST00000568388 WDR97A6NE52 1622 aa31.27■■■□□ 2.6
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
SPNS1-210ENST00000568388 KIF27Q86VH2 1401 aa31.14■■■□□ 2.58
SPNS1-210ENST00000568388 EEA1Q15075 1411 aa31.12■■■□□ 2.57
SPNS1-210ENST00000568388 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.09■■■□□ 2.57
SPNS1-210ENST00000568388 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
SPNS1-210ENST00000568388 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.09■■■□□ 2.57
SPNS1-210ENST00000568388 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
SPNS1-210ENST00000568388 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.03■■■□□ 2.56
SPNS1-210ENST00000568388 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.01■■■□□ 2.55
SPNS1-210ENST00000568388 OSCARQ8IYS5 282 aa30.98■■■□□ 2.55
SPNS1-210ENST00000568388 PBRM1Q86U86 1689 aa30.94■■■□□ 2.54
SPNS1-210ENST00000568388 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.94■■■□□ 2.54
SPNS1-210ENST00000568388 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.93■■■□□ 2.54
SPNS1-210ENST00000568388 IGF1RP08069 1367 aa30.93■■■□□ 2.54
SPNS1-210ENST00000568388 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
SPNS1-210ENST00000568388 GRIN2BQ13224 1484 aa30.91■■■□□ 2.54
SPNS1-210ENST00000568388 CUL7Q14999 1698 aa30.82■■■□□ 2.52
SPNS1-210ENST00000568388 CHD1O14646 1710 aa30.81■■■□□ 2.52
SPNS1-210ENST00000568388 PRXQ9BXM0 1461 aa30.76■■■□□ 2.52
SPNS1-210ENST00000568388 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
SPNS1-210ENST00000568388 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.75■■■□□ 2.51
SPNS1-210ENST00000568388 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.73■■■□□ 2.51
SPNS1-210ENST00000568388 KIF21BO75037 1637 aa30.73■■■□□ 2.51
SPNS1-210ENST00000568388 ADAMTS12P58397 1594 aa30.71■■■□□ 2.51
SPNS1-210ENST00000568388 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.71■■■□□ 2.51
SPNS1-210ENST00000568388 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.69■■■□□ 2.5
SPNS1-210ENST00000568388 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.69■■■□□ 2.5
SPNS1-210ENST00000568388 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.69■■■□□ 2.5
SPNS1-210ENST00000568388 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.66■■■□□ 2.5
SPNS1-210ENST00000568388 SYNJ2O15056 1496 aa30.62■■■□□ 2.49
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGEF11O15085 1522 aa30.59■■■□□ 2.49
SPNS1-210ENST00000568388 GOLGA3Q08378 1498 aa30.57■■■□□ 2.48
SPNS1-210ENST00000568388 FBLN2P98095 1184 aa30.56■■■□□ 2.48
SPNS1-210ENST00000568388 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
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