RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540260.1

FKBP4-204, Transcript of FK506 binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene FKBP4, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKBP4-204ENST00000540260 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.85■■■■■ 6.69
FKBP4-204ENST00000540260 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.39■■■■■ 5.66
FKBP4-204ENST00000540260 ABCC9O60706 1549 aa48.66■■■■■ 5.38
FKBP4-204ENST00000540260 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.48■■■■■ 5.19
FKBP4-204ENST00000540260 NACADO15069 1562 aa47.23■■■■■ 5.15
FKBP4-204ENST00000540260 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.16■■■■■ 5.14
FKBP4-204ENST00000540260 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.14■■■■■ 5.14
FKBP4-204ENST00000540260 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.14■■■■■ 5.14
FKBP4-204ENST00000540260 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.14■■■■■ 5.14
FKBP4-204ENST00000540260 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.06■■■■■ 4.96
FKBP4-204ENST00000540260 SCRIBQ14160 1630 aa45.91■■■■■ 4.94
FKBP4-204ENST00000540260 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.66■■■■■ 4.9
FKBP4-204ENST00000540260 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.51■■■■■ 4.88
FKBP4-204ENST00000540260 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.34■■■■■ 4.85
FKBP4-204ENST00000540260 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.42■■■■■ 4.7
FKBP4-204ENST00000540260 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.17■■■■■ 4.66
FKBP4-204ENST00000540260 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.12■■■■■ 4.65
FKBP4-204ENST00000540260 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.09■■■■■ 4.65
FKBP4-204ENST00000540260 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.05■■■■■ 4.64
FKBP4-204ENST00000540260 SMARCA4P51532 1647 aa44.02■■■■■ 4.64
FKBP4-204ENST00000540260 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.79■■■■■ 4.6
FKBP4-204ENST00000540260 SMARCA2P51531 1590 aa43.64■■■■■ 4.58
FKBP4-204ENST00000540260 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.63■■■■■ 4.57
FKBP4-204ENST00000540260 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.62■■■■■ 4.57
FKBP4-204ENST00000540260 NCAPD3P42695 1498 aa43.55■■■■■ 4.56
FKBP4-204ENST00000540260 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
FKBP4-204ENST00000540260 HMGXB3Q12766 1538 aa43.41■■■■■ 4.54
FKBP4-204ENST00000540260 WIZO95785 1651 aa43.34■■■■■ 4.53
FKBP4-204ENST00000540260 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
FKBP4-204ENST00000540260 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
FKBP4-204ENST00000540260 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
FKBP4-204ENST00000540260 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.41■■■■■ 4.38
FKBP4-204ENST00000540260 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.34■■■■■ 4.37
FKBP4-204ENST00000540260 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.27■■■■■ 4.36
FKBP4-204ENST00000540260 NESP48681 1621 aa42.26■■■■■ 4.36
FKBP4-204ENST00000540260 CFTRP13569 1480 aa42.16■■■■■ 4.34
FKBP4-204ENST00000540260 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.01■■■■■ 4.32
FKBP4-204ENST00000540260 PRDM2Q13029 1718 aa41.95■■■■■ 4.31
FKBP4-204ENST00000540260 ERCC6Q03468 1493 aa41.93■■■■■ 4.3
FKBP4-204ENST00000540260 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.84■■■■■ 4.29
FKBP4-204ENST00000540260 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.79■■■■■ 4.28
FKBP4-204ENST00000540260 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.71■■■■■ 4.27
FKBP4-204ENST00000540260 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
FKBP4-204ENST00000540260 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.53■■■■■ 4.24
FKBP4-204ENST00000540260 WDR62O43379 1518 aa41.4■■■■■ 4.22
FKBP4-204ENST00000540260 CUX2O14529 1486 aa41.35■■■■■ 4.21
FKBP4-204ENST00000540260 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
FKBP4-204ENST00000540260 ABCC8Q09428 1581 aa41.27■■■■■ 4.2
FKBP4-204ENST00000540260 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.21■■■■■ 4.19
FKBP4-204ENST00000540260 TOPBP1Q92547 1522 aa41.18■■■■■ 4.18
FKBP4-204ENST00000540260 CUX1P39880 1505 aa41.05■■■■■ 4.16
FKBP4-204ENST00000540260 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41■■■■■ 4.15
FKBP4-204ENST00000540260 TOP2BQ02880 1626 aa40.89■■■■■ 4.14
FKBP4-204ENST00000540260 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.89■■■■■ 4.14
FKBP4-204ENST00000540260 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
FKBP4-204ENST00000540260 SYNJ1O43426 1573 aa40.86■■■■■ 4.13
FKBP4-204ENST00000540260 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.84■■■■■ 4.13
FKBP4-204ENST00000540260 IFT140Q96RY7 1462 aa40.82■■■■■ 4.12
FKBP4-204ENST00000540260 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
FKBP4-204ENST00000540260 SOGA1O94964 1423 aa40.69■■■■■ 4.1
FKBP4-204ENST00000540260 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.64■■■■■ 4.1
FKBP4-204ENST00000540260 WDR97A6NE52 1622 aa40.53■■■■■ 4.08
FKBP4-204ENST00000540260 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
FKBP4-204ENST00000540260 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.5■■■■■ 4.07
FKBP4-204ENST00000540260 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
FKBP4-204ENST00000540260 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
FKBP4-204ENST00000540260 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.36■■■■■ 4.052e-7■■■■□ 23.2
FKBP4-204ENST00000540260 TRIM41Q8WV44 630 aa40.34■■■■■ 4.05
FKBP4-204ENST00000540260 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.31■■■■■ 4.04
FKBP4-204ENST00000540260 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.25■■■■■ 4.03
FKBP4-204ENST00000540260 GRIN2BQ13224 1484 aa40.19■■■■■ 4.02
FKBP4-204ENST00000540260 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.18■■■■■ 4.02
FKBP4-204ENST00000540260 PBRM1Q86U86 1689 aa40.16■■■■■ 4.02
FKBP4-204ENST00000540260 KIF27Q86VH2 1401 aa40.12■■■■■ 4.01
FKBP4-204ENST00000540260 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
FKBP4-204ENST00000540260 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.05■■■■■ 4
FKBP4-204ENST00000540260 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.03■■■■■ 4
FKBP4-204ENST00000540260 SYNJ2O15056 1496 aa39.88■■■■□ 3.97
FKBP4-204ENST00000540260 ADAMTS12P58397 1594 aa39.87■■■■□ 3.97
FKBP4-204ENST00000540260 IGF1RP08069 1367 aa39.85■■■■□ 3.97
FKBP4-204ENST00000540260 CHD1O14646 1710 aa39.83■■■■□ 3.97
FKBP4-204ENST00000540260 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.83■■■■□ 3.97
FKBP4-204ENST00000540260 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.82■■■■□ 3.96
FKBP4-204ENST00000540260 CUL7Q14999 1698 aa39.8■■■■□ 3.96
FKBP4-204ENST00000540260 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
FKBP4-204ENST00000540260 EEA1Q15075 1411 aa39.74■■■■□ 3.95
FKBP4-204ENST00000540260 FBLN2P98095 1184 aa39.73■■■■□ 3.95
FKBP4-204ENST00000540260 OSCARQ8IYS5 282 aa39.68■■■■□ 3.94
FKBP4-204ENST00000540260 GRIN2AQ12879 1464 aa39.67■■■■□ 3.94
FKBP4-204ENST00000540260 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.63■■■■□ 3.93
FKBP4-204ENST00000540260 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.52■■■■□ 3.92
FKBP4-204ENST00000540260 NUP160Q12769 1436 aa39.48■■■■□ 3.91
FKBP4-204ENST00000540260 PRXQ9BXM0 1461 aa39.48■■■■□ 3.91
FKBP4-204ENST00000540260 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.48■■■■□ 3.91
FKBP4-204ENST00000540260 CEP170Q5SW79 1584 aa39.44■■■■□ 3.9
FKBP4-204ENST00000540260 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.43■■■■□ 3.9
FKBP4-204ENST00000540260 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.41■■■■□ 3.9
FKBP4-204ENST00000540260 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.41■■■■□ 3.9
FKBP4-204ENST00000540260 KIF21BO75037 1637 aa39.28■■■■□ 3.88
FKBP4-204ENST00000540260 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.24■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms