Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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CTF1Q16619 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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CTF1Q16619 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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CTF1Q16619 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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