Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 AP2B1-216ENST00000616784 2542 ntTSL 59.02□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 LTBP4-229ENST00000601032 2019 ntTSL 1 (best)18.73■□□□□ 0.599e-7■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 TYK2-201ENST00000264818 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 TYK2-202ENST00000524462 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 MED24-221ENST00000580008 957 ntTSL 1 (best)19.86■□□□□ 0.771e-10■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 MED24-206ENST00000428757 1105 ntTSL 517.24■□□□□ 0.351e-10■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 CORO7-PAM16-201ENST00000572274 672 ntTSL 517.12■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 PRC1-201ENST00000361188 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 PRC1-202ENST00000394249 3034 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 OAZ1-210ENST00000593012 1357 ntTSL 219.7■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 OAZ1-201ENST00000581150 1131 ntTSL 517.93■□□□□ 0.462e-7■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 OAZ1-207ENST00000590943 1012 ntTSL 217.31■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.16e-8■■■■■ 39.6
UTP3Q9NQZ2 SRSF9-206ENST00000603963 1043 ntTSL 523.09■■□□□ 1.296e-8■■■■■ 39.6
UTP3Q9NQZ2 SRSF9-205ENST00000550458 327 ntTSL 312.81□□□□□ -0.366e-8■■■■■ 39.6
UTP3Q9NQZ2 FAM117A-207ENST00000509347 572 ntTSL 410.9□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 39.6
UTP3Q9NQZ2 FAM117A-203ENST00000503720 528 ntTSL 49.05□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 39.6
UTP3Q9NQZ2 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 39.6
UTP3Q9NQZ2 MAPK8-210ENST00000432379 907 ntTSL 318.56■□□□□ 0.565e-6■■■■■ 39.6
UTP3Q9NQZ2 MAPK8-208ENST00000426557 860 ntTSL 416.16■□□□□ 0.185e-6■■■■■ 39.6
UTP3Q9NQZ2 MAPK8-215ENST00000476134 732 ntTSL 38.16□□□□□ -1.15e-6■■■■■ 39.6
UTP3Q9NQZ2 HP1BP3-205ENST00000417710 572 ntTSL 59.65□□□□□ -0.865e-7■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 FAM35A-203ENST00000437629 969 ntTSL 325.51■■□□□ 1.679e-7■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.459e-7■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.699e-7■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 ACTB-211ENST00000480301 657 ntTSL 1 (best)22.38■■□□□ 1.178e-9■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 ACTB-210ENST00000477812 820 ntTSL 221.41■■□□□ 1.028e-9■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 ACTB-205ENST00000432588 568 ntTSL 417.09■□□□□ 0.338e-9■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 ACTB-206ENST00000443528 569 ntTSL 416.81■□□□□ 0.288e-9■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 ACTB-202ENST00000414620 561 ntTSL 416.55■□□□□ 0.248e-9■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 BAG6-237ENST00000375976 3644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.329e-7■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 RBM39-244ENST00000615771 686 ntTSL 59.29□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 RBM39-229ENST00000475651 555 ntTSL 56.51□□□□□ -1.375e-7■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.369e-7■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.179e-7■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.079e-7■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.819e-7■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 ACIN1-221ENST00000557432 642 ntTSL 313.35□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.91e-6■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.631e-6■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.51e-6■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.111e-6■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 PKM-219ENST00000567118 2254 ntTSL 212.37□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 39.5
UTP3Q9NQZ2 ISYNA1-213ENST00000583534 629 ntTSL 1 (best)21.68■■□□□ 1.062e-7■■■■■ 39.4
UTP3Q9NQZ2 ISYNA1-205ENST00000578352 592 ntTSL 220■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 39.4
UTP3Q9NQZ2 ISYNA1-208ENST00000581800 627 ntTSL 416.82■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 39.4
UTP3Q9NQZ2 LTBP4-224ENST00000599016 726 ntTSL 323.49■■□□□ 1.356e-7■■■■■ 39.4
UTP3Q9NQZ2 ANKRD12-209ENST00000585234 313 ntTSL 315.17■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 39.4
UTP3Q9NQZ2 ANKRD12-207ENST00000581635 631 ntTSL 411.98□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 39.4
UTP3Q9NQZ2 IRF3-216ENST00000597180 301 ntTSL 519.33■□□□□ 0.685e-7■■■■■ 39.4
UTP3Q9NQZ2 IRF3-226ENST00000600453 700 ntTSL 316.55■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 39.4
UTP3Q9NQZ2 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.19e-7■■■■■ 39.4
UTP3Q9NQZ2 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.199e-7■■■■■ 39.4
UTP3Q9NQZ2 ACTN4-206ENST00000489451 654 ntTSL 312.44□□□□□ -0.425e-7■■■■■ 39.4
UTP3Q9NQZ2 ABHD5-203ENST00000454293 464 ntTSL 321.1■□□□□ 0.974e-11■■■■■ 39.4
UTP3Q9NQZ2 ABHD5-201ENST00000013894 833 ntTSL 319.83■□□□□ 0.774e-11■■■■■ 39.4
UTP3Q9NQZ2 ABHD5-204ENST00000456453 876 ntTSL 414.45□□□□□ -0.14e-11■■■■■ 39.4
UTP3Q9NQZ2 HNRNPR-213ENST00000641107 646 nt16.38■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.549e-21■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.332e-6■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 AP2B1-219ENST00000620039 3428 ntTSL 1 (best)6.05□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 PISD-212ENST00000473770 2378 ntTSL 517.43■□□□□ 0.387e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.167e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.257e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 PISD-201ENST00000266095 2655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.537e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 ILF3-204ENST00000585835 849 ntTSL 314.49□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 MEPCE-204ENST00000497759 666 ntTSL 322.36■■□□□ 1.179e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.889e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.629e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 MEPCE-203ENST00000479201 592 ntTSL 215.5■□□□□ 0.079e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 LONP1-211ENST00000590558 2884 ntTSL 518.9■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 LONP1-206ENST00000587552 2816 ntTSL 216.2■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 GUK1-237ENST00000495999 555 ntTSL 316.78■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 SF3B2-213ENST00000533421 407 ntTSL 313.12□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM263-202ENST00000547081 833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.444e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.411e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.21e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.091e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.33e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.33e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 ESYT2-203ENST00000435514 2090 ntTSL 214.97□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 39.3
UTP3Q9NQZ2 U2SURP-215ENST00000493782 588 ntTSL 1 (best)12.76□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 39.3
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