Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GKN1Q9NS71 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GKN1Q9NS71 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKN1Q9NS71 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms