Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms