Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
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